用ncbi设计引物

封湛甄3130提取基因某片段的具体实施方法 -
程洪洋17575604162 ______[答案] 如果该基因是来自基因组已经测序的物种或是NCBI上面有提交的序列,比如水稻、人类、拟南芥、酵母等,可以通过NCBI上的保守序列设计PCR引物,以提取该物种的基因组DNA为模板,通过PCR进行扩增,凝胶电泳回收后得到目的片段.如果你...

封湛甄3130已知动物PRL基因序列如何设计引物 已解决 -
程洪洋17575604162 ______ 2,上游引物设计:选取正向5'-3'的基因序列约23bp左右,copy下来;在这段序列的5'端加上你的上游酶切位点(一般6bp),再在之前加入两个任意碱基作为保护碱基;序列为:保护碱基(2bp)+上游酶切位点(6bp)+基因起始序列5'...

封湛甄3130微小RNA本来就比较短,引物如何设计 -
程洪洋17575604162 ______ 你是要pcr cDNA吗?一般就是设计引物能够跨越至少一个exon-exon junction的,就是引物在两个exon的交界处,这样pcr的时候就不会有DNA污染.现在NCBI可以直接有引物设计,还可以选择上述的设计方式,或者可以通过找到cDNA序列然后...

封湛甄3130什么是引物? -
程洪洋17575604162 ______ [编辑本段]概念 引物,是一小段单链DNA或RNA,作为DNA复制的起始点,在核酸合成反应时,作为每个多核苷酸链进行延伸的出发点而起作用的多核苷酸链,在引物的3′-OH上,核苷酸以二酯链形式进行合成,因此引物的3′-OH,必须是游离...

封湛甄3130RNA引物设计怎么设计? -
程洪洋17575604162 ______[答案] 你是要pcr cDNA吗? 一般就是设计引物能够跨越至少一个exon-exon junction的,就是引物在两个exon的交界处,这样pcr的时候就不会有DNA污染 现在NCBI可以直接有引物设计,还可以选择上述的设计方式 或者可以通过找到cDNA序列然后自己在...

封湛甄3130我想学习PCR引物设计可却不知道怎么下手 -
程洪洋17575604162 ______ 你首先要明白,引物是什么?为什么要设计引物?明白了之后,再去看资料和网上设计引物的介绍,一定能明白.关于设计引物的步骤和注意事项,网上太多了,我相信你不是问这个,我跟你介绍一下设计引物的意义,说说实验里的作用吧....

封湛甄3130简并引物是什么?设计的原则或原理是什么 -
程洪洋17575604162 ______ 利用NCBI搜索不同物种中同一目的基因的蛋白质或cDNA编码的氨基酸序列 因为密码子的关系,不同是指代表编码单个氨基酸所有不同碱基可能性的不同序列的混合物.密码子具有简并性,单以氨基酸顺序推测编码的DNA序列是不精确的,但可以设计成对简并引物,扩增所有编码已知顺序的核酸序列.用简并引物时寡核苷酸中核苷酸序列可以改变,但核苷酸的数量应相同.的核苷酸序列可能表达的氨基酸序列是相同的,所以氨基酸序列才是真正保守的

封湛甄3130设计得引物有多对,怎么确定哪一对最好 -
程洪洋17575604162 ______ 1 基因有多种变体,该怎么设计? 你如果仅仅检测这个基因的表达量,你可以将引物设计在这多种变体的保守区域内,就是所有变体都包含的区域.如果你明确要检测哪一个变体,就设计在这个变体独有的区域内. 2 引物blast后的产物有多种 你应该是在NCBI上进行的primer blast吧?你只要看到你的引物扩增出来的都是你要的目的基因就好了.在NCBI上有很多标记,一般认为NM的是NCBI上认可的reference的序列,NX是用户上传还未认证的序列,你忽略也是可以的.predicted是指用户预测的序列,建议你还是用NCBI认证的序列.

封湛甄3130DNA分子标记中引物怎么设计? -
程洪洋17575604162 ______ 找出DNAstar,BLAST等程序,可以帮你设计,也可以自己手工设计,根据碱基互补原则设计,需要到NCBI中BLAST一下,以排除可能误配的序列,当然也可以请引物合成公司帮你设计

封湛甄3130想问下各位高人,设计引物时没有所找物种的基因序列,想问下怎么进行多物种序列比对,找到相对保守区域呢 -
程洪洋17575604162 ______ 找近缘种,越近越好,的那个基因 都下下来ncbi或软件都可以比对,找高度保守区 具体操作为,蛋白序列和DNA序...