microrna测序分析

姜桂淑1947一株细胞的microrna研究可以发sci吗 -
卫宙尹18917535691 ______ 一株细胞的microrna研究可以发sci microRNAs(miRNA)是一种大小约21-23个碱基的单链小分子RNA,是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链 对从事生物学、医学与药学专业的研究生而言,能让自己的文章在SCI期刊发表是一种莫大的荣耀.说的世俗一些,一篇SCI论文(哪怕是IF低于1.5分的期刊)会为一名硕士带来不少荣耀.当然了,对博士研究生而言,SCI的IF是关系到其能否顺利毕业的保证.前期在论坛上看到博士毕不了业,对导师以死相逼.究其原因仅仅是因为一纸论文.发表SCI论文真的有那么难吗? 笔者看来有实验结果SCI论文发表其实不是一件难事.

姜桂淑1947环境微生物宏基因组测序结果如何分析? -
卫宙尹18917535691 ______ 宏基因组即生境中全部微小生物遗传物质的总和.它以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象, 以功能基因筛选和测序分析为研究手段, 以微生物多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系为研究目的.宏基因组学技术第一次使人类得以研究占环境中99%的不可培养的微生物种群,从而成为微生物研究的最前沿领域 对环境样本进行DNA提取后进行16S或18S等区域扩增,再对扩增产物进行建库、测序,然后对所得的数据进行生物信息学分析.生物信息分析主要包括OTU的生成及rank-abundance分析、取样充足性分析、丰度和多样性分析、菌群间差异分析、假设验证分析、进化树分析等.

姜桂淑1947miRNA深度测序有什么技术特点? -
卫宙尹18917535691 ______ miRNA深度测序?你意思高通量测序吧.技术特点没什么可说的,如果你了解高通量测序的流程的话.mirna一般是通过割胶回收短序列RNA,建好mirna的文库后,进行高通量测序.只不过mirna测序分析有一些特点,比如说mirna的预测,以及靶基因的预测(主要基于数据库比对和mirna的前体的发卡结构).

姜桂淑1947如何筛选目的基因的miRNA
卫宙尹18917535691 ______ 你指的是寻找miRNA的靶基因位点吗? 一般都是利用生物信息学软件进行预测,但这种预测都是有局限性的,比如miRNA可能会与靶基因之间产生错配,这样会丢失一些靶基因,另外预测的都未经过实验的验证,还需要进行实验的验证来去伪存真. 当然植物可以使用降解组测序的方法来进行靶基因预测,原理就是植物中miRNA与mRNA往往是碱基近乎完全匹配来结合后将mRNA降解,剪切位点通常位于miRNA的第十位或第十一位碱基,被剪切后的片段可以通过建库后进行测序,可以真实的得到miRNA在mRNA上的作用位点的序列. 动物的就不行了,动物中一般是miRNA结合在mRNA上对mRNA翻译进行抑制,无法像植物那样得到其降解后的小片段进行测序验证

姜桂淑1947降解组测序的原理? -
卫宙尹18917535691 ______ 植物中miRNA通过剪切的方式将mRNA降解掉来抑制翻译过程,动物中主要是结合在3'UTR区域进行抑制,也有部分是降解;所以降解组测序常出现在植物的研究中. 然后获取这些降解后得到的小片段进行建库,上机测序,一是根据测得的结果推出其的互补序列,另外miRNA一般是在自己的第11位碱基进行剪切的. 另外还要借助生物信息学工具targetfinder来做一个反向的预测,两个结果综合,即可得到比较可信的靶基因结果.

姜桂淑1947跪求哪家公司做microRNA芯片比较好啊?急等毕业 -
卫宙尹18917535691 ______ 做microRNA芯片最好的平台应该是丹麦Exiqon 公司,这家公司是专门研究microRNA的,并且使用该芯片发表的文章在国内被SCI收录已经40多篇文章了,不过丹麦Exiqon 公司在中国合作伙伴只有康成生物公司.我们实验室曾经在他们那里做过,效果还不错. 如果你需要我可以把他们有业务员留给我的技术资料发给你.

姜桂淑1947测序mirna分析为什么rrna trna snrna 含量少于15 -
卫宙尹18917535691 ______ RNA指 ribonucleic acid 核糖核酸 核糖核苷酸聚合而成的没有分支的长链.分子量比DNA小,但在大多数细胞中比DNA丰富.RNA主要有3类,即信使RNA(mRNA),核糖体RNA(rRNA)和转移RNA(tRNA).这3类RNA分子都是单链,但具有不同的分子...

姜桂淑1947如何筛选目的基因的miRNA -
卫宙尹18917535691 ______ 你指的是寻找miRNA的靶基因位点吗? 一般都是利用生物信息学软件进行预测,但这种预测都是有局限性的,比如miRNA可能会与靶基因之间产生错配,这样会丢失一些靶基因,另外预测的都未经过实验的验证,还需要进行实验的验证来去伪存真. 当然植物可以使用降解组测序的方法来进行靶基因预测,原理就是植物中miRNA与mRNA往往是碱基近乎完全匹配来结合后将mRNA降解,剪切位点通常位于miRNA的第十位或第十一位碱基,被剪切后的片段可以通过建库后进行测序,可以真实的得到miRNA在mRNA上的作用位点的序列. 动物的就不行了,动物中一般是miRNA结合在mRNA上对mRNA翻译进行抑制,无法像植物那样得到其降解后的小片段进行测序验证

姜桂淑1947转染micrornamimics之后靶基因mrna会降低吗
卫宙尹18917535691 ______ 转染microrna mimics之后靶基因mrna会降低microRNAs(miRNA)是一种大小约21-23个碱基的单链小分子RNA,是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经...

姜桂淑1947miRNA的靶基因怎么预测 -
卫宙尹18917535691 ______ 免疫沉淀 当然,确定miRNA与mRNA之间的互作,我们还有更直接的方法,那就是从实验上寻找物理相互作用.我们可以利用RNA诱导沉默复合物(RISC)中的Argonaut(AGO)蛋白的抗体进行免疫共沉淀(co-IP).生物通 www.ebiotrade.com 目...