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pka排序

来源:baiyundou.net   日期:2024-09-24

氨基酸的等电点(Isoelectric Point,pI)是指氨基酸分子在某一特定的pH值下,其净电荷为零的状态。计算氨基酸等电点的基本方法涉及到考虑氨基酸分子中各官能团(例如,氨基和羧基)的pKa值(酸解离常数的负对数值),并使用这些值来找到在这些官能团全部或部分被质子化的pH范围中,氨基酸分子的净电荷为零的pH值。

1、对于无特殊官能团的标准氨基酸:

(1)首先,查找氨基酸的羧基(-COOH)和氨基(-NH2)的pKa值。

(2)使用以下公式计算等电点:

2、对于有一个额外官能团的氨基酸(例如带有额外的羧基或氨基的氨基酸):

(1)查找氨基酸的所有官能团的pKa值。

(2)将pKa值从低到高排序。

(3)使用中间两个pKa值来计算等电点:

3、对于有两个或更多额外官能团的氨基酸:

(1)与上面类似,首先确定所有官能团的pKa值。

(2)将pKa值从低到高排序。

(3)根据氨基酸在中性pH下的总净电荷,选择适当的中间pKa值来计算等电点。

特别注意,氨基酸的pKa值可能因文献或来源而异,因此使用准确的pKa值是很重要的。实际上,最好的方法是直接查找文献中给出的特定氨基酸的pI值。如果需要进行精确的计算或有特定应用,可能还需要考虑溶液条件(如离子强度、温度等)对pKa值的影响。

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