sds提取dna步骤
[实验原理]
在 EDTA 和 SDS 等去污剂存在下,用蛋白酶 K 消化细胞,随后用酚抽提,可以得到哺乳 动构基因组 DNA,用此方法得到的 DNA 长度为 100-150 kb,适用于 L 嘴菌体构建基因组 文库和 Southern 分析。
通过本实验了解并掌握提取基因组 DNA 的原理和步骤,以及相对分子质量较大的 DNA的 琼脂糖凝胶电泳技术。
[仪器、材料与试剂]
(一)仪器
1.台式离心机
2.玻璃匀浆器
3.高压灭菌锅
4.恒温水浴
(二)材料
1.1.5mL 微量离心管
2.微量取样器和吸头
3.无菌过滤器(一次性)
4.10 mL 注射器
5.鼠肝
6.三羟甲基氨基甲烷(Tris)
7.十二烷基硫酸钠(SDS)
8.乙二胺四乙酸(EDTA)
9.蛋白酶 K
10.RNA 酶
11.DNA 相对分子质量标准物,DNA/EcoRI+HindⅢ相对分子质量标准物
(三)试剂
1、1.5 mol/L\tNaCl
2、0.5 mol/L Tris·HCI\tpH8.0
3.0.5 mol/L EDTA\t\tpH8.0
4.3 mol/L NaAc\tpH5.2 以上均高压灭菌。
5.蛋白酶 K 10mg/mL 配好后用一次性过滤器过滤,-20 保存(教师配制)
6.组织匀浆液 100mmol/LNaCI,10mmol/LTris·HCl(pH 8.0),0.25mmol/ LEDTA(pH8.0)
7.酶解液 200mmol/LNaCI,20mmol/L Tris·HCI(pH 8.O),50mmol/LEDTA(PH 8.0),200~g/mL 蛋白酶 K,1%SDS
8.无 DNA 酵的 RNA 酶 : 将胰 RNA 酶溶解于 10mmol/L Tris.HCI(pH7.5)、15 mmol/L NaCl 溶液中,浓度 l0mg/mL,于 100℃水浴处理 15min,以降解 DNA 酶,缓慢冷 却到室温,-20℃保存
9.TE 缓冲液 :10mmol/LTris·HCl(pH8.0),25 mmol/LEDTA(pH8.0)
10.平衡酚(pH8.0):氧仿:异戊醇=25:24:1<体积比)
11.氧仿:异戊醇=24:l(体积比)
12.5xTBE 5.4gTris,2.75g 硼酸 2mL 0.5mol/L EDTA(pH8.0),加水到 100mL;
13.6x 上样缓冲液 o.25%溴酚蓝,40%(W/V)蔗糖水溶液
14.λDNA/EcoRI+/HindⅢ 相对分于质量标准物片段(bP)21 227,5148,4 973,4 268,3 530,2 027,1 904,1 584,1 315,947,831,564,125
[实验步骤]
本实验在无液氮的条件下,铡备鼠肝 DNA,与有液氮条件下相比,产量和质量都有所下 降。整个操作过程中,应尽量避免 DNA 酶的污染,特 g4 注童动作温和,减少对 DNA 的 机械捌伤。
1、取 0.2g 鼠肝,用冰冷的生理盐水洗 3 次,然后置于 2.0mL 匀浆掖中,用玻璃匀浆器匀 浆至无明显组织块存在(冰浴操作,切匆将细胞破碎,可镜检观察)。
2、将组织细胞移至 1.5ml 离心管中,50000rpm 离心 30-60sec,(尽可能在低温下操作), 弃上清,若沉淀中血细胞较多,可再加入 1 倍于细胞体积的匀浆液洗一次。
3、沉淀加 0.8mL 无菌水迅速吹散,分两管,再加 0.4mL 酵解液,翻转混匀(动作一定要 轻)55℃水浴处理 12-18 h;
4、沉淀加 RNase 至终浓度 200µg/mL,37℃水浴 1 h;
5、加入等体积酚/氯仿/异戊醇抽提一次,(慢慢旋转混勾,倾斜使两相接触面增大)。4℃、 10min、10000rpm 离心;
6、有时如果 DNA 含量过高,水相在下层,实验时应注意观察。用扩口吸头移出含 DNA的水相(注意勿吸出界面中蛋白沉淀),加等体积氧仿/异戊醇,4℃、10 000rrpm 离心 10rain (若界面或水相中蛋白含量多,可重复 1.6 操作)。
7、用扩口吸头小心吸出上层含 DNA 的水相,加 1/10 体积的 NaAc,小心混匀(要充分), 再向每管中加入 2.5 倍体积的无水乙醇,-20 过夜。
8、12 000rpm 离心 19min,弃上清,75%冷乙醇洗涤一次,12000rpm 离心 15min 室握温干燥(不要大干,否则 DNA 不易溶解),加入适量 TE 缓冲液,存放于 4℃,轻摇溶解过夜,即可得 到实验动物基因组 DNA。
9、电泳鉴定 DNA,由于基因组 DNA 相对分子质量较大,用 0.3%的琼脂糖凝胶电泳鉴定, 先在底部锦一层 1%的支持胶,凝固后再铺上一层 0.3%琼脂糖凝胶,插上梳子(枚子不能瑾 到的支持胶)。取 1.5µL 溶解的 DNA、1µL 上样缓冲液和 35µl 无菌水混匀后小心上样(可在 另一孔加 DNA 相对分于质量标准),观察基因组 DNA 大小,用溴化乙锭染色观察结果。
[注意事项]
1、操作过程尽量在低温下进行,避免 DNA 降解。
2、琼脂糖凝胶脆弱,应小心操作。
3、提取得到的基因组 DNA 应为单一条带,DNA 降解可形成弥散带型。
闵燕纪2840DNA提取过程中的关键步骤及注意事项有哪些? -
陈萍江18681164254 ______ 1、 裂解液要预热,以抑制DNase,加速蛋白变性,促进DNA溶解. 2、 酚一定要碱平衡.苯酚具有高度腐蚀性,飞溅到皮肤、粘膜和眼睛会造成损伤,因此应注意防护.氯仿易燃、易爆、易挥发,具有神经毒作用,操作时应注意防护. 3、 各操作步骤要轻柔,尽量减少DNA的人为降解. 4、 取各上清时,不应贪多,以防非核酸类成分干扰. 5、 异丙醇,乙醇.NaAc,KAc等要预冷,以减少DNA的降解,促进DNA与蛋白等的分相及DNA沉淀. 6、 提取DNA过程中所用到的试剂和器材要通过高压烤干等办法进行无核酸酶化处理. 7、 所有试剂均用高压灭菌双蒸水配制.
闵燕纪2840请问:怎样提取微生物的质粒(DNA)? -
陈萍江18681164254 ______[答案] 碱提法: 一、试剂准备 1.溶液Ⅰ:50mM葡萄糖,25mM Tris-HCl(pH 8.0),10mM EDTA(pH 8.0).1M Tris-HCl(pH 8.0)12.5ml,0.... 溶液Ⅲ为中和溶液,此时质粒DNA复性,染色体和蛋白质不可逆变性,形成不可溶复合物,同时K+使SDS-蛋白复合物沉淀. ...
闵燕纪2840如何获得高纯度植物基因组DNA -
陈萍江18681164254 ______ 传统的DNA 提取与纯化,如 CTAB 法、SDS 法是在裂解细胞的基础上,多次苯酚氯仿等有 机溶剂抽提使蛋白质变性沉淀于有机相,而核酸保留在水 相,达到分离核酸的目的;加入RNA 酶除去核酸中的RNA; 然后加入异丙醇、乙醇等沉淀DNA...
闵燕纪2840动物组织提取基因组DNA的步骤和试剂 -
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闵燕纪2840如何简单地提取植物的基因,如何简单地对另一棵植物注射基因(我只是一个即将毕业的小学生,不要太复杂) -
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闵燕纪2840DNA提取方法有哪些 -
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闵燕纪2840如何从猪脾中提取DNA?实验方法介绍下! -
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陈萍江18681164254 ______ 以牛蒡为原料,研究牛蒡多酚的超声辅助提取工艺及其抗菌作用.结果表明,牛蒡多酚提取最佳工艺条件为:物料粒径为80目,超声功率为300 W,超声提取时间为20 min,乙醇质量分数为80%,液料比值为24(m L/g).牛蒡多酚对细菌、霉菌和酿酒酵母都有很强的抑制效果,其抗菌谱较宽.牛蒡多酚对大肠杆菌、金黄色葡萄球菌和沙门氏菌的MIC为6.25%,对黑曲霉和枯草芽孢杆菌的MIC为12.5%,对酿酒酵母和根霉的MIC为25%.
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