turner综合征特点
在利用常规全外显子组测序(WES)技术进行临床辅助诊断时,常常面临多种问题:
·动态突变检测覆盖不全,常常需要补充其他技术方案,能否覆盖更全面?
·CNV分辨率低、基因高度同源,临床缺乏诊断依据,怎样才能提高检出率?
·染色体嵌合难以捕捉,漏检导致难诊断,如何检测更精准?
针对以上WES临床应用常见问题,雅济科技进行了产品全面升级,推出增强全外显子组测序2.0,以充分解决常规WES未能突破的局限。
升级一:外显子级别CNV精准自动识别
·自主研发Tiny_CNV算法,专注于单个外显子,杂合缺失更灵敏——有效避免漏检
·可区分同源多比对区域——HBA1/HBA2、SMN1/SMN2异常检测
·提供三种算法进行异常标注——兼具可靠性与准确性
升级二:动态突变检测新增10余种,准确率再提升
·新增10余种动态突变精准检测(SCA1-3、SCA6-8、SCA12、SCA17、FRDA、DRPLA、HD、SBMA、MMD1/2等)
·平均准确性高达94%以上
升级三:性染色体异常检测性能再增强
·有效区分XXY、XXX、X0等异常结果及嵌合变异
升级四:智能报告系统再优化
·自研算法AegiVar结合AI技术,致病性评级更精准、更智能
·内部数据库结合公共数据库资源整合,自动更新——临床诊断性更强
以上升级基于雅济科技独家生物信息学分析系统WEAVERTM再优化进行,针对CNV异常、动态突变、性染色体异常三种在临床中的重点情况进行分析升级,并增强智能报告系统,提高检出率、达到更高检测效率,从而为临床提供更优质的辅助诊断选择。
案例
患者信息:男,12岁。
临床诊断:轻度尿道下裂,疑似矮小症,生长激素不敏感。
既往检测:2020年曾进行全外显子检测,结果阴性。
家族史:先证者母亲孕 6 次,产 2 次,曾引产一个30周胎儿,流产物基因检测结果为FGFR3突变,现有两名子女,先证者父亲曾长期接触X射线。
基因检测方案:先证者增强全外显子检测+父母Sanger验证
检测结果:45,X/46,XY嵌合体
雅济智能报告系统(AEGIS)显示CNV提示结果:Y染色体存在嵌合缺失。
CNV结果图
基因检测结论:该样本存在性染色体异常,为45,X/46,XY嵌合体。
45,X/46,XY嵌合体临床表型特点主要以外生殖器及性腺发育异常、身材矮小伴或不伴Turner综合征相关表型异常。
该患者家庭在雅济科技进行基因检测前,所进行的常规全外显子检测存在性染色体嵌合判断局限,导致求医初期未检测出患者Y染色体异常,通过增强全外显子组测序,能够精准捕获异常,及早明确病因,推进后续精准诊疗。
总结
对于临床上常见的拷贝数变异、假基因以及一些特殊变异机制,常规全外显子基因检测普遍存在一定的局限性,往往需要针对性的补充技术进行进一步检测。雅济科技2.0增强全外显子检测产品基于独家专利的WEAVERTM生信算法,对上述局限进行查缺补漏,一次检测便可解决多种变异类型,进一步增强全外显子检测的整体性能,对于患者而言,花一次检测费用,同时解决多种技术难题,性价比更高。对于医生而言,可以有效提高临床疑难病例的诊断效率,满足临床对疑难疾病的辅助诊断需求,同时更有利于挖掘临床科研价值病例转化。
在未来,雅济科技还将持续进一步钻研分析算法、进一步开发AI技术,随着临床需求的发展而不断优化,为精准医疗提供更好的支持。
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