做工精细的blast分析

咸邢剂4195如何通过blast判断一条dna序列是正向还是负向 -
祁桑汤18183799381 ______ 引物大吗? 如果二十几个bp以上的话,能查出来 正向引物不变,反向引物找反向互补序列,(就是说AATCGGATCCTCj就要翻成GAGGATCCGATT)把这两个序列用两个空格分开,或者用逗号隔开去blast,为了精确,应该在高级选项限制条件里选择你要的那种生物,你要的那种基因(比如是酶就选择酶那一类). 然后在结果里认真找哈~~

咸邢剂4195如何使用ncbi核苷酸blast -
祁桑汤18183799381 ______ Blast(Basic Local Alignment Search Tool)是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具.BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较.BLAST结果中的得分是对一种对相似性的统计说明. BLAST 采用...

咸邢剂4195BLAST怎么看是不是目的基因 -
祁桑汤18183799381 ______ 把两条引物输入,用blastn搜索,输出结果按相似性程度由高到低排列.包括相似序列的名字、位置,如果单独从名字无法看出基因情况,再链接到该序列的信息去查看. 如果你是要验证引物的特异性,就要看看,是不是相似性高的非目标区域出现.

咸邢剂4195ncbi上的blast序列比对工具怎么使用,求具体操作指南.
祁桑汤18183799381 ______ 1)输入fasta格式序列 2)选择核算比对

咸邢剂4195HPRD怎么分析蛋白间的关系?有一批基因,想分析它们靶蛋白的关系
祁桑汤18183799381 ______ 我的理解是这样的:用BLAST分析你的基因与什么基因同源, 有那些典型的结构功能域, 属于什么基因家族, 然后通过阅读文献你会大致了解这些同源基因有什么功能. 在以上信息的综合分析基础上, 合理推测你的目标基因可能具有的功能, 最后通过实验来验证. 这是途径一. 二, 如果上述分析的结果没有多少可利用的信息, 采取目前国际上流行的KNOCK OUT,KNOCK IN, KNOCK DOWN 手段, 在实验动物水平上发掘; 三, 还有一个寻找切入点的有效方法就是Y2H, 先看哪些蛋白能与之相互作用,然后用其它方法验证, 这就够你忙一阵子了.然后看看根据这些结果讲个什么样的故事.

咸邢剂4195可否介绍一下ncbi中blast的用法,详细点 -
祁桑汤18183799381 ______ 先到: http://130.14.29.110/BLAST/index.shtml 选择 Nucleotide-nucleotide BLAST (blastn) 然后在Search旁边那个大方框里填你要寻找的序列,然后点 BLAST! 然后按 Format! 这时会弹出一个新的窗口,慢慢等个十几秒几十秒……出来的结果会将找到的序列按是否接近排列出来.点最左边一栏(例:gi|114690489|ref|XR_025388.1|)的话会给你看找到的序列的详细介绍,而如果点Score bits下面的数字就可以看见你输入的序列和他们在数据库找到的序列的对比.上面Query一行是你输入的,下面Sbjct是数据库里的序列.

咸邢剂4195如何分析扩增的基因含有启动子和信号台序列 -
祁桑汤18183799381 ______ 将扩增得到的基因进行测序,得知序列信息后,进行如下操作: 1. 如果这个基因的来源物种已经完成了全基因组测序,那么恭喜你,你只需进入NCBI网站,把自己得到的序列与网站数据库中该物种的序列进行BLAST,就会得知这个基因的全部信息,包括外显子、内含子等等; 2.如果没有,仍然进入上述网站,将自己的序列进行BLAST分析,找到其它物种中与之同源的基因,参照那个基因进行分析; 3.还有一种不保险的方法,就是利用启动子预测软件、蛋白分析软件进行分析,因为毕竟是软件,所以有时候分析结果是错的,有时候是对的.

咸邢剂4195生物信息学中blast是什么意思 -
祁桑汤18183799381 ______ blast n. 爆炸; 一阵(疾风等); (吹奏乐器、哨子、汽车喇叭等突然发出的) 响声; 突如其来的强劲气流; vt. 击毁,摧毁; 尖响; 裁判高声吹哨; 枯萎:使枯萎; vi. 爆炸; 吼叫; 枯萎:枯萎; 攻击:严厉批评或猛烈攻击; [例句]There is a risk that toxic chemicals might be blasted into the atmosphere. 爆炸后有毒化学物质可能会进入大气层. 生物信息学中应该是枯萎的意思.

咸邢剂4195克隆未知基因的序列,测序后BLAST进行了比对,是我们想要的序列,接下来对序列还要进行什么分析? -
祁桑汤18183799381 ______ 看你的实验目的啊.如果只想做个片段,那就进行下生物信息学分析,比如多重序列比对、生物进化树分析、蛋白质结构预测等.

咸邢剂4195如何利用NCBI中的Primer - BLAST设计引物 -
祁桑汤18183799381 ______ 引物大吗? 如果二十几个bp以上的话,能查出来 正向引物不变,反向引物找反向互补序列,(就是说AATCGGATCCTCj就要翻成GAGGATCCGATT)把这两个序列用两个空格分开,或者用逗号隔开去blast,为了精确,应该在高级选项限制条件里选择你要的那种生物,你要的那种基因(比如是酶就选择酶那一类). 然后在结果里认真找哈~~