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作者:yasden
16线程的cpu活力全开跑代码主机竟然没有噪音
8核16线程的cpu-4800H跑大数据分析,设置分析软件使用14个线程(剩下两个线程我是用来浏览网页,还有听歌使用的,毕竟一边跑代码一边也要听歌上网的),其中8个线程100%完全使用(见下图),还有2个线程占用率90%以上,4个线程占用率在71%到89%之间,这么高强度的使用,风扇一点都没有声音(个人感觉cpu满速使用时,主机风扇的声音和图书馆背景噪音一样安静,也就是说,这款迷你主机可以带到图书馆里面来跑代码,不用担心有任何的噪音)。
![](https://p0.ssl.img.360kuai.com/t0123e6b2e4fa49d6b4.jpg)
这款巴掌大小的迷你主机,准系统只要1049元,配备8核16线程,如果你家里有升级剩下的DDR4笔记本内存条,也有多余的固态硬盘的话,买来跑代码非常的省电,全机最大功耗65瓦,cpu的14个线程火力全开,风扇噪音和图书馆里面一样安静,即使旁边有人在睡觉也几乎感受不到这个噪音。
这是我近来发现的跑代码的小钢炮主机,该机有两个DDR4笔记本内存插槽,比较适合24小时不间断跑代码:
![](https://p0.ssl.img.360kuai.com/t01afd1b4d47cf6b90c.jpg)
这款迷你主机采用8核心16线程的4800H的cpu,cpu典型TDP功耗45瓦(见下图),所以整机最大功耗可以做到65瓦。如果你办公室有显示器和鼠标,你可以像我一样,每天带着上下班,这款主机安装好内存和硬盘后只有645克。
![](https://p0.ssl.img.360kuai.com/t01f44a4bcba7984197.jpg)
别看4800H这款cpu是笔记本电脑的cpu,cpu benchmarks的跑分1万8,和AMD的5500cpu是一个档次的水平。一句话,这就是性能小钢炮。
![](https://p0.ssl.img.360kuai.com/t0157edceda5c062169.jpg)
samtools第一种安装方法:利用conda来安装
用conda来安装软件非常方便,但是我在安装samtools软件的时候,遇到了问题,conda安装samtools的命令见下图:
![](https://p0.ssl.img.360kuai.com/t0175852a2ca20d4bb6.jpg)
无论是使用conda install -c bioconda samtools
还是使用conda install -c "bioconda/label/cf201901" samtools
我发现,无论是用上面的那一种conda安装方法,在运行samtools的时候,都会报错,报错信息如下:
samtools: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0: cannot open shared object file: No such file or directory
我在网络上查找了很多资料,例如cd到类似的lib目录下,例如我的电脑是这个目录:~/anaconda3/envs/python2.7/lib,然后ln -s libcrypto.so.1.1 libcrypto.so.1.0.0也还是会报错:
samtools: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0: cannot open shared object file: No such file or directory
最后,无奈只能去samtools的官网查找解决方法:
![](https://p0.ssl.img.360kuai.com/t019c046cdd0b819fea.jpg)
第2种安装方法:按照samtools官网的方法来安装
samtools的官网是类似上图这样的。
首先下载samtools-1.18文件,解压缩后cd到这个文件夹里面,之后执行下面的4步:
第1步:
cd samtools-1.18
其中samtools-1.18是你解压缩之后的生成的文件夹,这个文件夹你要自己决定,因为这个文件夹也许是/home/yasden/samtools-1.18,你将这个samtools-1.18文件解压缩到哪里,这个samtools-1.18文件夹就在那里。
第2步:
./configure --prefix=/你想安装的目录
我这里是设置成./configure --prefix=/home/yasden/RNA-seq/samtools,这个步骤会遇到很多的情况,例如configure: error: liblzma development files not found等类似的问题(见下图遇到的问题是zlib development files not found这样类似的问题):
![](https://p0.ssl.img.360kuai.com/t010649195acecb6364.jpg)
遇到像是“某某某development files not found”这些类似问题的时候,就百度解决方法。例如liblzma development files not found就用sudo apt-get install liblzma-dev的方法来安装 liblzma-dev解决,直到运行./configure --prefix=/home/yasden/RNA-seq/samtools没有任何报错为止。
遇到zlib development files not found这样的问题,用sudo apt install zlib1g-dev来解决(见下图,不知道怎么解决就百度)。
![](https://p0.ssl.img.360kuai.com/t019983a72cfb74aeec.jpg)
第3步:
make
第4步:
make install
第5步:
安装完成后,用sudo vi /home/yasden/.bashrc来修改.bashrc文件:
在.bashrc这个文件的最后添加一行:export PATH=/home/yasden/RNA-seq/samtools/bin:$PATH,并保存退出。
第6步:
运行source ~/.bashrc
这时候,命令行输入samtools就不会报错了。
![](https://p0.ssl.img.360kuai.com/t0117606414d3703230.jpg)
![](https://p0.ssl.img.360kuai.com/t012ca6ce07f258ea95.jpg)
利用samtools软件见sam文件转化成bam文件,4800H的AMD-cpu的占用情况见上图,铭凡的UM480XT迷你主机只有65瓦,跑大数据分析的时候,风扇的声音都听不见,巴掌大小的铭凡的UM480XT迷你主机绝对是linux跑代码的神器!这台迷你主机大小就是一台iPhone8 plus手机的大小:
![](https://p0.ssl.img.360kuai.com/t01f1e3004b384ee4a7.jpg)
全文完,谢谢观看。
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