blast如何比对两个序列

聂骆竖4104求助:ncbi蛋白blast结果 -
黄菲侍15673074074 ______ +号表示的是相似性质的氨基酸残基.

聂骆竖4104基因序列比较怎么分析? -
黄菲侍15673074074 ______ 看你是要对比几条序列了,双序列比对需要BLAST,NCBI上有,也可以在百度搜索本地版的下载下来,多序列比对需要cluxtal X软件, 要把所有基因序列fasta格式放在一起,需要输入所有序列的fasta格式,然后进行多序列联配!

聂骆竖4104序列比对的基本原则是什么 -
黄菲侍15673074074 ______ 序列比对[1] 是生物信息学[2] 的基本组成和重要基础.序列比对的基本思想是,基于生物学中序列决定结构,结构决定功能的普遍规律,将核酸序列和蛋白质一级结构上的序列都看成由基本字符组成的字符串,检测序列之间的相似性,发现生物...

聂骆竖4104使用blast进行蛋白质双序列比对,出现警告. -
黄菲侍15673074074 ______ 出现这个警告是因为序列内部有非ATCG的未知碱基,不会对结果有太大影响,做blast很容易出现这种警告

聂骆竖4104blast什么意思? -
黄菲侍15673074074 ______ BLAST (Basic Local Alignment Search Tool)是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具.BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较.BLAST结果中的得分是对一种对相似性的统计说明. BLAST 采用一种局部...

聂骆竖4104想问下各位高人,设计引物时没有所找物种的基因序列,想问下怎么进行多物种序列比对,找到相对保守区域呢 -
黄菲侍15673074074 ______ 找近缘种,越近越好,的那个基因 都下下来ncbi或软件都可以比对,找高度保守区 具体操作为,蛋白序列和DNA序...

聂骆竖4104如何寻找两个基因间的序列 -
黄菲侍15673074074 ______ 首先你要确定这两个基因确实在同个染色体或者质粒上,然后距离是多少?如果距离太远,要先用GenomeWalker 缩短空白序列,然后试着用PCR.如果是人体基因,就直接Blast.http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi

聂骆竖4104如何在blast 下载序列 -
黄菲侍15673074074 ______ 点击你需要的序列的lucas号,底下有选项CDS,cDNA,fulllenghtcDNA,点进去就可以下载了.

聂骆竖4104如何构建本地的blast数据库? -
黄菲侍15673074074 ______ 假设有一序列数据(sequence.fa,多序列,fasta格式),欲自己做成Blast数据库,典型的命令如下:核酸序列:$ ./formatdb –i sequence.fa –p F –o T/F蛋白序列:$ ./formatdb –i sequence.fa –p T –o T/F执行blast:获得了单机版的Blast程序,解...

聂骆竖4104如何在酵母数据库中通过蛋白序列blast得到氨基酸序列 -
黄菲侍15673074074 ______ NCBI NCBI下有很多数据库,以下是蛋白质序列 PopSet 包含研究一个人群、一个种系发生或描述人群变化的一组组联合序列.PopSet既包含核酸序列数据又包含蛋白质序列数据. Entrez 功能强大,在于它的大多数记录可相互链接,既可在同...