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ncbi数据库入口

来源:baiyundou.net   日期:2024-09-24


Geneious拥有您组织所需的所有分子生物学和序列分析工具。无论您是想提高生产力,增加可视性和洞察力,还是减少错误和风险,我们的软件解锁了您实验室数据中所有的价值。

 

提高生产力

我们认为,研究人员不应该必须拥有编程技能才能发现新的科学知识。

 

Geneious通过提供直观的、用户友好的界面,将原始序列数据转换为有意义的可视化,使生物信息学变得可访问。

                 

提高能见度和洞察力

Geneious提供了分子克隆、基因组学、抗体筛选和序列分析的基本工具。

 

行业领先的算法,强大的分析和卓越的可视化,让您在探索数据的同时获得关键的见解。

增强合作

将序列数据的管理和分析集中在一个平台上。将您的序列与分析结果和NCBI数据一起存储和组织。

 

通过直观的基于文件夹的组织和无缝集成的共享数据库转换跨团队的协作。

 

减少错误和风险

创建自动化工作流程。添加自己的自定义算法,与现有系统集成。直接在Geneious Prime和Geneious Biologics之间共享文件。

 

为您提供Geneious的工作,以提高效率,控制业务流程,并减少研究中的人为错误。


2024.0 版本

功能:

• 克隆验证:可视化和半自动的验证工具,用于添加、导出和记录验证元数据

• Map to Reference(s):提供指导和帮助决定尝试哪种算法的交互式测验

 

次要功能和可用性改进:

• 云数据库:现在,当SSL设置时,可以正确使用自定义SSL证书。高级选项中的CustomTrustedCertificates

• De Novo Assembly:在互动测验中增加了替代汇编器的建议

 

修复和小改动:

 • 反向翻译:修正了在一些大型序列列表上没有结果的问题

• 批量重命名:修复了创建高级批量重命名时罕见的挂起问题

• CRISPR:修复了安装和调用Doench 2016的过程

• 更改传播:修正了手动编辑可能导致更改错误传播的问题

• Custom BLAST:修正了有时用户无法安装NCBI自定义数据库的错误

• DeSeq2:修复了罕见的错误,即多个间隔的注解没有被正确比较

• 通用:修复了罕见的崩溃,当Geneious Prime关闭时

• 导入:修正了导入excel文件时的一个罕见问题

• Map to Reference(s):修复罕见的崩溃

• 搜索:修复了一个罕见的bug,当插件被移除时,搜索菜单可能会崩溃

• Trim Ends:修正了从工作流中裁剪序列时不正确的跟踪注释

 

其他:

• Anneal Oligos:更新了工作流,以正确显示悬垂,如果他们在同一串

 

2024.0.1 补丁

修复和小改动:

• 注释生成器:修正了在注释预测过程中更改设置产生不正确结果的问题

• BLAST:

1、修正了一个本地BLAST数据库在其包含文件夹被移动时可能被损坏的问题

2、导出为BLAST文本格式时,按原始查询序列分组命中

• 克隆验证:修正了跳转开始和结束按钮有时不显示的错误

• 叠连群视图:修复了大型contigs排序时偶然的崩溃

• 导入:修正了GFF序列名称中的某些字符在导入时导致崩溃的错误

• Lineage:修复了在某些情况下手动编辑序列时引入错误数据的罕见bug

• Map to Reference:修正了一个有很多歧义的引用没有从BBMap的结果中链接的错误

• 引物:

1、修正了在使用保存的引物运行测试时无法正确检测别名文档的错误

2、修正了复制翻译引物可能失败的错误

• SAM/BAM导入器:修正了硬修剪读取会被导入到错误位置的错误

• 序列视图:修复所选注释有时在保存更改后发生更改

• UniProt:修复数据库搜索

 

2024.0.2 补丁

修复和小改动:

• 导入:修正了excel导入器无法导入包含非拉丁字符的文件的错误

• Map to reference:当在引用序列的末尾有一个相对于结构变体的插入时,修复崩溃或不正确的对齐

 

北京天演融智软件有限公司(科学软件网)是Geneious软件在中国的授权经销商,为中国的软件用户提供优质的软件销售和培训服务。


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容元昌1358怎么找基因序列? -
蓬所券13122251338 ______ 我一般是在NCBI上面找,世界上有三个大的数据库,NCBI是其中一个,美国的,这个我觉得是最好的.在上边查找基因序列方法是: 首先打开NCBI网站首页,然后在search一栏中选择nucleotide,在框中输入你要的基因序列名称,点击search...

容元昌1358我想要应用NCBI的BLAST找到人和鼠的MyD88氨基酸序列,并比较它们之间的同源性,想请教您 -
蓬所券13122251338 ______ 1 进入NCBI首页http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 2 蛋白库中输入MyD88,可找到人和鼠的MyD88, 人(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/AAC50954.1), 小鼠(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/AAC53013.1) 3 可以下载序列用软件做本地比对...

容元昌1358如何查找某机构所发的全部论文? -
蓬所券13122251338 ______ 到ncbi主页上,http://www.ncbi.nlm.nih.gov 在页面上方的搜索栏内输入usc cell apoptosis, 在左边的下拉菜单中选择PubMed数据库,然后搜索即可

容元昌1358我现在有一物种的引物序列,想通过引物在NCBI中找到它的登陆号,不知道怎样才能找到?谢谢 -
蓬所券13122251338 ______ 在NCBI中BLAST引物(注意选择BLAST的数据库),然后再Blast结果中找寻符合要求的序列.后面会列出很多链接,直接就能看到NCBI号 进入http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/Blast.cgi?PAGE=Nucleotides&PROGRAM=blastn&...

容元昌1358ncbi embl和什么并称三大数据库 -
蓬所券13122251338 ______ DDBJ:DNA Data Base of Japan 是日本人建立的核酸数据库; NCBI中的Genbank是美国建立的核酸数据库; EMBL是欧洲建里的核酸数据库; 这三个数据库是连通的,数据共享.

容元昌1358NCBI上的BGD什么意思?还有GI?是数据库吧? -
蓬所券13122251338 ______ 都是RefSeq的编号NW是gene的,XM是mRNA的,XP是protein的,详见 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?highlight=xm&rid=helpgene.table.EntrezGene.T2 gi是序列(如gene,protein,mRNA...)存入NCBI数据库时顺序assign的一个数字,便于database管理和监控. 跟上面的那些没有关系 参考资料: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?highlight=xm&rid=helpgene.table.EntrezGene.T2

容元昌1358如何在ncbi上查找基因的mRNA产物 -
蓬所券13122251338 ______ 在NCBI主页,在All database 下拉选择Nucleotide,然后输入你要查找的基因名,出来的页面右侧筛选Homo...等等,意思是筛选显示人的,然后对照你要找的基因的转录本号,点FASTA,就会出来你要找的mRNA序列

容元昌1358基因DB是什么?哪位大神给讲解下? -
蓬所券13122251338 ______ 你提供的信息太少了,不过可以简单猜测一下.DB既然全大写,我猜"基因DB"是指"gene database",而gene database会有很多不同的具体实例,我们生物研究最常用的,可能要数NCBI的gene database了.因此,这里我猜测“基因DB”就是指NCBI维护的Gene database这个数据库,网址如下:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/ 这个数据库存储了很多以基因为中心的信息,包括序列、功能、定位、发表文献等信息,可以查询、下载或跳转到其它相关数据库.这里有个好的起点来了解这个数据库:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK3841/

容元昌1358求PTEN基因的 序列 -
蓬所券13122251338 ______ 该基因的基因组序列:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_000010.10?report=genbank&from=89623195&to=89728532 mRNA序列:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/110224474 蛋白质序列:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/73765544 基因的定位描述:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Retrieve&dopt=full_report&list_uids=5728

容元昌1358如何查找基因之间相互作用的数据库 -
蓬所券13122251338 ______ 在NCBI主页上方search栏左边有一个database选择框,点击下拉三角形选择nucleotide(如图红框)在search栏输入基因名搜索即可.以人的orc1基因为例,在搜索结果中选择mRNA和complete cds序列的结果都可以,如下点击进入序...

(编辑:自媒体)
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