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怎么在ncbi验证引物

来源:baiyundou.net   日期:2024-09-25

都蓉购4032怎样使用ncbi查找一些已经设计好的引物 -
郜琪制19444233607 ______ 还是用primer premier来设计吧 然后去ncbi上blast一下看下特异性

都蓉购4032已知引物序列,怎么得到PCR目的片段大小 -
郜琪制19444233607 ______ 进入NCBI网站,点击BLAST,输入一段引物序列,进行BLAST,会得到一些与之匹配的基因;然后再用另一段引物序列进行BLAST.比较两次结果,找到引物所匹配的基因,BLAST的时候会告诉你引物在这个基因中的位置,自己计算一下就可以了.

都蓉购4032NCBI的Primer - BLAST怎么用 -
郜琪制19444233607 ______ rimer-BLAST的输入Primer-BLAST界面包括了Primer3和BLAST的功能.提交的界面主要包括三个部分:targettemplate(模板区),theprimers(引物区),和specificitycheck(特异性验证区).跟其它的BLAST一样,点击底部的“...

都蓉购4032求助在NCBI中找到目的基因该怎样设计引物 -
郜琪制19444233607 ______ 首先 不管是前引物还是后引物,都得在设计引物时在5'端加一段保护序列(网上搜保护序列 有很多) 其次 在保护序列之后要加酶切位点(网上搜酶切位点) 然后 后引物还要加终止密码子(3个随便加) 最后 目的基因前后的序列按5'到3'的顺序分别加在前后引物上

都蓉购4032如何在genebank中查找PCR所需引物 -
郜琪制19444233607 ______ 在GenBank里面输入你要P的东西的物种名称和你的具体的名称,譬如是一种酶的名称,搜到了RNA序列或者是DNA序列,再根据这些片段设计引物. 另外纠正下你的写法是GenBank,而不是GeneBank.

都蓉购4032在NCBI中怎么用已知的引物找目的基因(微生物) -
郜琪制19444233607 ______[答案] 在NCBI中需要选核算那个选项,然后写出微生物英文缩写名称,另外最好写上该基因片段名称.点击搜索即可.会搜到很多基因,找几个典型的基因,然后复制到txt文档里,用DNAStar的editseq来查询已知引物所在位置.不懂继续问.还望采纳哈~

都蓉购4032在NCBI中如何查找rabies virus狂犬病毒(ERA菌株)的序列? -
郜琪制19444233607 ______ 1、首先进入NCBI的首页,可在百度中输入ncbi查找即可 2、选中核苷酸序列,输入rabies virus,点击回车 3、找到所要的结果,我已经把搜索的结果粘贴下了,你复制下面的链接级可以访问 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/EU877071.1 4、...

都蓉购4032什么是引物? -
郜琪制19444233607 ______ [编辑本段]概念 引物,是一小段单链DNA或RNA,作为DNA复制的起始点,在核酸合成反应时,作为每个多核苷酸链进行延伸的出发点而起作用的多核苷酸链,在引物的3′-OH上,核苷酸以二酯链形式进行合成,因此引物的3′-OH,必须是游离...

都蓉购4032我想咨询大家PCR引物设计如何选基因序列 -
郜琪制19444233607 ______ 要看你的实验目的,如果是一般检测,你将模板序列输到引物设计软件里,一般选评分高的引物,然后最好去blast一下,看看它的特异性

都蓉购4032我做的植物SSR引物设计,现在发现我的SSR引物PCR反应后,用PAGE电泳的结果会出现多条带,正常吗?为什么? -
郜琪制19444233607 ______ 验证你的引物是否特意:首先,再设计完一对因为后,要去NCBI上blast一下,看看是否会有很多条产物出现,如果产物单一的是目的片段,基本可以确定你的引物是特意的了. 另外,如果PCR反应后出现多条条带,有可能是退火温度低,导致产物不特意,你可以试试梯度PCR,先确定最佳的退火温度.当然有些基因比较不容易扩增,无论什么温度,基本上出现的都是很多条带.比较正常.目的片段3K以上这个情况还是比较常见的.

(编辑:自媒体)
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