primer+blast验证引物

童睿盛1787PCR产物与预期的大小不同,且出现两种产物,如何解释? -
祖吴柴13534349708 ______ 1、引物特异性不好,建议用引物设计软件看看引物错配和二聚体形成的情况,oligo软件还是不错的,个人觉得比primer好.2、退火温度较低,建议设置温度梯度,特别是在原先的基础上提高一些.

童睿盛1787PUBMED中查找到的引物怎么检测 -
祖吴柴13534349708 ______ 可用primerBlast功能检测.

童睿盛1787如何选择Premier Primer 5设计出来的引物 -
祖吴柴13534349708 ______ 1 选个得分最高的, 2 引物3`端没有碱基互补配对 3 引物在NCBI做一个primer blast.也可以直接在NCBI上设计引物啊

童睿盛1787进行BLAST比对,确定序列的登录号和序列编号.我想知道登录号和序列编号的格式 -
祖吴柴13534349708 ______ BLAST (Basic Local Alignment Search Tool)是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具.BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较.BLAST结果中的得分是对一种对相似性的统计说明. 在NCBI上分为多种,...

童睿盛1787引物怎样设计才能包含所有的目的序列 -
祖吴柴13534349708 ______ 1.在参数里指定产物/目的片段包含的区域,比如从哪个碱基开始多少个碱基2.或者在输入序列区,用[ ]将要扩增出来的序列标出来.这是网页版Primer3的处理方式,你可以参考一下

童睿盛1787如何设计sybrgreen法荧光定量pcr引物 -
祖吴柴13534349708 ______ 引物 荧光定量PCR 是利用荧光定量PCR 仪(如ABI 7500、stepone、ROChe LightCycler、Bio-Rad CFX96 等)通过实时追踪 PCR 每一步循环的荧光信号 值来达到对起始模板量的定量分析.一次成功的荧光定量 PCR 反应除了需要稳 定的仪器...

童睿盛1787请问,能不能根据已知引物查证其对应基因?如果能,请指教,详细些.谢谢! -
祖吴柴13534349708 ______ 一个最简单的办法,你可以去NCBI上面的blast下,使用Primer blast,然后输入你自己的引物,在下面Specificity check中把Organism中默认的Homo sapiens点掉,然后输入你用的物种的名称,要不就不填.后面的Database选择Resfeq mRNA,然后点击get premer.接着NCBI就会把你的引物和GenBank中所录入的所有mRNA序列对比,给出能够PCR扩出的所有基因,你只要看下有没有你的序列就OK了.如果你有已知的序列,那么把序列直接输入上面的sequence 中,然后把你的引物输入进去,接着你然后点击get premer,就可以看到你的引物能不能扩增出你的序列了.

童睿盛1787什么是引物? -
祖吴柴13534349708 ______ [编辑本段]概念 引物,是一小段单链DNA或RNA,作为DNA复制的起始点,在核酸合成反应时,作为每个多核苷酸链进行延伸的出发点而起作用的多核苷酸链,在引物的3′-OH上,核苷酸以二酯链形式进行合成,因此引物的3′-OH,必须是游离...

童睿盛1787提取细菌DNA检测到有条带,PCR后无条带;而基因组DNA检测到无条带的,PCR后却有条带.怎么解释? -
祖吴柴13534349708 ______ PCR扩增的结果和模板的质量有直接的关系,在PCR扩增中如果模板纯度高,很低的量都可以进行扩增的.提取细菌的DNA量不多但纯度高,即使DNA电泳检测不到条带,PCR仍然能扩出条带.希望你看明白了.

童睿盛1787设计得引物有多对,怎么确定哪一对最好 -
祖吴柴13534349708 ______ 1 基因有多种变体,该怎么设计? 你如果仅仅检测这个基因的表达量,你可以将引物设计在这多种变体的保守区域内,就是所有变体都包含的区域.如果你明确要检测哪一个变体,就设计在这个变体独有的区域内. 2 引物blast后的产物有多种 你应该是在NCBI上进行的primer blast吧?你只要看到你的引物扩增出来的都是你要的目的基因就好了.在NCBI上有很多标记,一般认为NM的是NCBI上认可的reference的序列,NX是用户上传还未认证的序列,你忽略也是可以的.predicted是指用户预测的序列,建议你还是用NCBI认证的序列.