blast序列比对怎么看结果

郭庙辉4650可否介绍一下ncbi中blast的用法,详细点 -
鞠嘉潘18421587979 ______ 先到: http://130.14.29.110/BLAST/index.shtml 选择 Nucleotide-nucleotide BLAST (blastn) 然后在Search旁边那个大方框里填你要寻找的序列,然后点 BLAST! 然后按 Format! 这时会弹出一个新的窗口,慢慢等个十几秒几十秒……出来的结果会将找到的序列按是否接近排列出来.点最左边一栏(例:gi|114690489|ref|XR_025388.1|)的话会给你看找到的序列的详细介绍,而如果点Score bits下面的数字就可以看见你输入的序列和他们在数据库找到的序列的对比.上面Query一行是你输入的,下面Sbjct是数据库里的序列.

郭庙辉4650生物信息学菜鸟问:已知一基因,怎样查询它有几个exon;已知一个snp位于外显子上,如何查询它为于几号exon -
鞠嘉潘18421587979 ______ 进入NCBI网站,点击BLAST,进入后,按照提示输入已知基因的序列,然后进行BLAST(比对的意思). 结果会告诉你有很多基因跟这个基因同源,只是同源度不同而已. 然后你选择同源度为100%的那个基因,点击进去后,会告诉你这个基因的详细信息. 比如,有几个外显子,几个内含子,分别位于基因的什么位置等等. 查询SNP方法同上,在得到BLAST结果后,仔细查看比对的结果,会发现这个SNP所处的位置,然后看这个位置在哪个外显子上就可以了. 生物信息学中每个问题的答案多种多样,你要自己多去尝试,找到适合自己的方法.

郭庙辉4650基因序列BLAST比对 -
鞠嘉潘18421587979 ______ 把你的序列粘进去blast,出现的结果列表里面去找所谓的“ANME菌”.结果中如果这个序列跟A菌的序列的相似度很高,那你的序列就很可能是这个菌了.(这个blast的过程就是你的序列和所有序列比较的过程,当然包括A) 如果确实要做两两比较,那你把A菌的序列下下来,在软件里面比对.

郭庙辉4650有没有比较不同种属蛋白质同源性的 -
鞠嘉潘18421587979 ______ 要比较不同种属蛋白质的同源性,首先需要确认蛋白氨基酸序列 通过氨基酸序列比较,可以确定其蛋白质的同源性是多少 将不同种属蛋白质的氨基酸序列输入到比较软件中,通过软件的计算分析,即可以得出不同种属蛋白质的同源性

郭庙辉4650NCBI Blast 中的黑色、蓝色、绿色、粉色和红色都是什么意思?
鞠嘉潘18421587979 ______ 也就是说你的样品序列和网上序列的比对率,小于40bp重合就是黑色,50-80是绿色,大于200bp就是红色,

郭庙辉4650序列比对的基本原则是什么 -
鞠嘉潘18421587979 ______ 序列比对[1] 是生物信息学[2] 的基本组成和重要基础.序列比对的基本思想是,基于生物学中序列决定结构,结构决定功能的普遍规律,将核酸序列和蛋白质一级结构上的序列都看成由基本字符组成的字符串,检测序列之间的相似性,发现生物...

郭庙辉4650测序后如何分析基因突变? -
鞠嘉潘18421587979 ______ 1. 假设你测的是一个基因的序列,如果已知这个基因的序列,则将你测序得到的基因序列与已知的序列相比对,分析看两者在哪个地方不对应,不对应的地方即为突变的地方.比对的软件有sequencher,或者去NCBI网站点击BLAST进行. 2. 如果你测的是一个以前未知的序列,那么要测几个不同的单克隆,将测得的结果进行比对,分析一致的地方以及不一致的地方.

郭庙辉4650怎样进行局部比对 生物信息学 -
鞠嘉潘18421587979 ______ BLAST 可以进行两序列,也可以进行多序列比对.你可以查一下,在NCBI上可以在线BLAST.建议你先借几本生物信息学方面的书了解一下.

郭庙辉4650请问,已知蛋白序列的GI号,怎样在NCBI中查找对应蛋白的序列啊? -
鞠嘉潘18421587979 ______ 举个例子吧.搜索GI号为386311839的蛋白质 进入NCBI主页,选择Protein数据库,输入GI号,点击search 然后就OK了..