blast怎么找同源基因
郭嵇元1738如何使用NIBC比较一个物种某基因与其他物种的同源性 -
游视包13761629136 ______ 怎么找楼上说了,我说补充问题.你有两种发法,1是直接在blast的结果下面就能看到,比如Evalue 只是粗略比较的话,用这个就可以看到,哪个物种的和鸭MEF2D基因最相似,第二相似......第二个比较麻烦,要论文的话,一般要做出系统发育树,blast自带的那个树只是定性的,要把你觉得有必要比较的下载到本地,用clastalw或者mega等软件进行比对.这种东西,网上问是没希望回答清楚的,尤其是怎么使用那几个软件,你找你们学校会的同学吧
郭嵇元1738如何利用＂同源克隆＂获得新基因 -
游视包13761629136 ______ 分几种情况:如果你知道改基因的同源基因,可以采用同源克隆的方法,根据同源基因设计简并引物,RT-PCR,拿到中间片段,然后RACE拿到全长;或者根据EST序列电子克隆,RT-PCR,然后RACE拿到全长.如果该基因没有参考序列,就比较难办,可以构建cDNA文库,然后测序序列分析,看看能不能的到目的片段,再根据目的片段设计引物扩增
郭嵇元1738如何在Blast上基因定位 -
游视包13761629136 ______ Blast不是来定位基因的,而是搜索和你手头的序列相似的其他序列的!定位基因去EST DB上搜吧.
郭嵇元1738我有几段基因序列想在gebank上测下同源性,可是我没用过,哪位可以详细告诉我应该怎么操作啊 -
游视包13761629136 ______ 在NCBI中,单击BLAST后进行alignment,将手头上的基因序列输入框中,进行比对,应该可以
郭嵇元1738已知一个基因名称和它的序列,怎样明确找出该基因功能区(N端或C端)~~谢谢!! -
游视包13761629136 ______ 1. 利用基因比对功能.进入NCBI网站,点击BLAST,输入基因序列,找到与之同源度最高的基因,点击进入后,会告诉你这个基因的详细信息,包括哪儿是外显子,哪儿是内含子,等等. 2.利用生物信息学软件.应用GeneScan软件,专门用来分析基因的一款软件,输入基因序列,同样会告诉你该基因的详细信息. 建议用1最可靠,因为2毕竟是预测,而1是实打实地根据实验信息得到的结果.
郭嵇元1738如何找到基因和自己相同人!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!! -
游视包13761629136 ______ 长得和你一样的人应该差不多了,但也可能差很多.这种人,基本不存在 DNA寻祖是可行的.因为一般的寻祖都是分析男性的Y染色体.因为Y染色体只来自于父辈,所以有一定的遗传稳定性,比X染色体更能说明亲缘关系.但是实施起来比较复杂.
郭嵇元1738已知一个小鼠基因A,如何利用EST分析得到人类基因组中与A基因同源的基因?分步骤回 -
游视包13761629136 ______ 这个方法是以序列相似一定就是同源基因为基本假设的,一般而言这样做是可行的.但就同源基因本身这个概念来讲我们可以认为同源基因基本都是序列相似的,但这并不能代表序列相似就一定是同源的首先关于同源的定义就比较多,如果以序列相似性作为唯一依据话,可以采用NCBI上的blast软件进行序列比对.用basic blast 中的nucleotide blast软件,将基因A提交给服务器,排列越前的就是同源性越高的,在参数设置的database中选EST(expressed sequence tags),进行blast,返回的结果中
郭嵇元1738怎么用bioedit在基因组序列中找出已知序列的序列相似 -
游视包13761629136 ______ Bioedit提供了本地blast工具(菜单里的local blast 功能),如图一. 你需要把基因组数据做成本地数据库,使用菜单里的create a local nucleotide database file功能建立本地DNA数据库,建库的原始数据需要做成fasta格式的,建成的数据库存放在...\bioedit\database文件夹里. 然后用另一种菌的基因序列和基因组本地数据库做blastn或者tblastx(图二),就能找到与这个基因序列相似性较高的contig了. 我的bioedit版本较低,估计也能参考吧. 也可以直接从NCBI下载本地blast相关程序,使用dos命令行操作.
郭嵇元1738如何利用已知基因设计特异性引物 -
游视包13761629136 ______ 首先在NCBI进行blast比对,找到基因的特异序列,与其他基因同源性低的区域,然后再这些区域设计引物.还有一种方法是先在基因上设计引物,然后再blast比对引物,看看在你的目的物种中是否有同源基因.
郭嵇元1738如何寻找两个基因间的序列 -
游视包13761629136 ______[答案] 首先你要确定这两个基因确实在同个染色体或者质粒上,然后距离是多少?如果距离太远,要先用GenomeWalker 缩短空白序列,然后试着用PCR. 如果是人体基因,就直接Blast.