kegg+pathway+database

隆岩丽2350怎么将基因组测序结果匹配到染色体上 -
匡震幸18562706091 ______ 代谢通路是kegg数据库里的pathway数据库.可以通过全基因组预测了编码基因后,进行pathway数据库注释,从注释结果的功能信息中通过关键字查找.一般都能找到.如果找不到,有可能是关键字不对或者基因组中没有这样的代谢通路功能基因.一般现在的科技服务公司如果做了keggpathway数据库注释的话,都会做代谢通路图的注释,可以从结果文件中的代谢通路图查找,找到想要的代谢通路图后,再分析哪些基因在基因组上存在.

隆岩丽2350全基因组基因表达谱用来证明什么 -
匡震幸18562706091 ______ 也就是常说的数字基因表达谱,Digital gene expression (DGE).它主要用来获得差异表达基因,比如对正常植株和干旱处理的植株进行DGE分析,根据差异表达的基因我们可以鉴定到潜在的干旱响应基因,同时对这些差异表达基因进行GO注释和KEGG pathway注释可以发现哪些通路响应了干旱.如果实验没有头绪,可以用该方法寻找思路,比如说鉴定到一些表达及其异常的基因,就可以重点关注它们,后续进行功能分析;如果前期实验鉴定到了一些响应干旱的基因,可以再用DGE分析,如果刚好这些基因在DGE分析中也差异表达,两者也可以互相验证.

隆岩丽2350KEGG PATHWAY里红色字表示什么意思 -
匡震幸18562706091 ______ 什么红色的字?

隆岩丽2350如何研究信号传导通路?请问研究某种受体或蛋白的下游信号传导通路,实验设计的一般方法,都有哪些?谢谢
匡震幸18562706091 ______ 在KEGG或BioCarta这些pathway数据库里找到你感兴趣的通路,在pathway图上找到你感兴趣的蛋白后就能确认它的下游.实验方法大体上就是上调(瞬时表达、mimics)或下调(Knockout、RNAi)你的Gene of Interest,再检测下游的蛋白发生了上调还是下调,看看你的GOI和它们什么联系.

隆岩丽2350如何研究lncrna与mrna的关系? -
匡震幸18562706091 ______ 1.LncRNA简要LncRNA是一类转录本长度超过200nt的RNA,它们本身并不编码蛋白,而是以RNA的形式在多种层面上(表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等)调控基因的表达水平.生物体内含量相相当丰富,约占RNA的4-9%(mRNA约...

隆岩丽2350研究模式生物的一个基因功能主要有哪些途径 -
匡震幸18562706091 ______ 你是指的该基因所参与的代谢途径?GO或KEGG PATHWAY分析就可以了.已经测序的直接查基因组的注释信息应该就可以查到.