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简单的序列比对法

来源:baiyundou.net   日期:2024-09-24

厍恒友4691怎么做序列比对啊,怎么做基因查找呢,找到以后要用那部分呢?我目前?
甫风俘13534096260 ______ 找基因的话从NCBI.打开NCBI主页,右上方有个可选框,即可查找.序列比对的话可以用DNASTAR软件.挺好用的.

厍恒友4691MegAlign,ClustalX和MUSCLE三种方法的结果是否存在差异 -
甫风俘13534096260 ______ MegAlign,ClustalX和MUSCLE三种方法的结果基本相似,差异不大.MegAlign,ClustalX和MUSCLE都属于多序列比对的方法,ClustalX用的是累进算法进行比对,MUSCLE用的是迭代方法进行比对运算, MegAlign是累进和迭带都可以用.累进...

厍恒友4691如何用clustalx做序列同源比对后的结果图 -
甫风俘13534096260 ______ 多序列比对在分子生物学中是一个基本方法,用来发现特征序列,进行蛋白分类,证明序列间的同源性,帮助预测新序列二级结构与三级结构,确定PCR引物,以及在分子进化分析方面均有很大帮助,Clustal W(Dos版本)很适合这些方面的要求,Clustal X是window版本. 用Clustal比对后的序列,有时候我们需要转为图片放在文章作详细方析,但大部分人的方法都是直接截图,这样的后果就是图片一点都不美观.如果你是想要发表文章或其它比较重要的用途,图片的质量还是需要高一点的.

厍恒友4691如何获得一个基因所在的序列 原位杂交 -
甫风俘13534096260 ______ 原位杂交(in situ hybridization) 将标记的核酸探针与细胞或组织中的核酸进行杂交,称为原位杂交.使用DNA或者RNA探针来检测与其互补的另一条链在细菌或其他真核细胞中的位置.RNA原位核酸杂交又称RNA原位杂交组织化学或RNA原位...

厍恒友4691怎么进行核酸序列比对? -
甫风俘13534096260 ______ 容易了,我每天都在做这个 上NCBI的blast http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/seq/BlastGen/BlastGen.cgi?taxid=4530 把你的序列拷贝过去, Database:这个选Refseq RNA,其它参数默认.. 你肯定没有选择数据库,是在水稻的全基因组里搜索了,因为NC_008397是chromosome 4的全长序列.. 不懂你再call我......另,在Tiger上的分析还不如NCBI..其实结果是一样的.

厍恒友4691同一种酶不同物种中的基因如何进行多序列比对? -
甫风俘13534096260 ______ 你所做的工作应该是寻找某个物种中的某一个基因在其它物种中的同源基因(ortholog)然后再做进化树那种吧.进行多序列比对有许多软件都可以做到,DNAman我用的比较多的是alignment而不是multisequence alignment.给你推荐一些软件,一个是clustalx,一个是MEGA,这两个软件都可以进行蛋白多序列比对,而后者我认为更强大些,还可以进行进化树分析.把你所有从NCBI上找到的CDS导入到软件中(一般做同源分析都是用蛋白质序列).然后用软件进行比对就可以了,结果可以输出为多种形式,比如fasta或者其它格式,软件用法我这里也不多讲了,必须看专用的手册.如果还有不明白就发信息给我

厍恒友4691怎样比较两种病毒的核苷酸序列? -
甫风俘13534096260 ______ 用DNA序列别对软件,DNAtool或者Amp,也可以从网上进行比对,从Genbank中将两个的基因序列的FASTA文件下载下来,按照软件的操作进行一步一步的比对就可以了!如果还不是很清楚的话,可以将你的基因序列给我,我帮你比对!

厍恒友4691CLUSTALW产生的矩阵是什么意思 -
甫风俘13534096260 ______ CLUSTALW是一种渐进的多序列比对方法,先将多个序列两两比对构建距离矩阵,反应序列之间两两关系;然后根据距离矩阵计算产生系统进化指导树,对关系密切的序列进行加权;然后从最紧密的两条序列开始,逐步引入临近的序列并不断...

厍恒友4691加密的PDF怎么解密 -
甫风俘13534096260 ______ 打开pdf文档的加密有口令加密和证书加密两种,如果是证书加密的是无法破解的,如果是口令加密,用Advanced PDF Password Recovery Pro这款软件来破解.功能限制(无法打印、无法复制等)密码用PDF...

厍恒友4691个体间比较的绩效考核方法局限性包括哪些 -
甫风俘13534096260 ______ 转载以下资料供参考 常用的绩效考核方法 一、简单排序法 (一)简单排序法的含义 简单排序法也称序列法或序列评定法,即对一批考核对象按照一定标准排出“1 2 3 4 ……”的顺序. 该方法的优点和缺点. (二)简单排序法的操作 首先,拟定考核的项目.

(编辑:自媒体)
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