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bioedit如何截取序列

来源:baiyundou.net   日期:2024-09-23

空琛琳3007如何使用bwa只输出一条比对结果 -
邬古咐18353777156 ______ 首先要把所有的序列复制到windows自带的记事本中,全部以fasta格式存到同一个文件中,保存成*.txt,序列内部最好不要有空格或者换行.序列格式举例如下:“>序列1 ATCG.ATCG>序列2 ATCG.ATCG>序列3 ATCG.ATCG>序列4 ATCG.ATCG” 然后用Bioedit打开刚才保存的文件*.txt,点击窗口上方的Accessory application菜单,再点击clustelW multiple alignment,这时候会弹出一个窗口,直接选择Run clustalW,又弹出一个窗口,选择ok,等待结果就行了.最后的比对结果可以保存成*.fas格式,适用于各种分析.

空琛琳3007bioedit怎样变成text -
邬古咐18353777156 ______ 生工测序结果一般都提供两个文档,一个是TEXT的序列文档,一个是用Chromas软件打开...下载BioEdit软件 第一:打开Bioedit软件,导入拼接好的样品序列与标准亚型参考序列 ...

空琛琳3007jquery 如何获取有序列表的序号 -
邬古咐18353777156 ______ jquery里面有css选择器 代码大概如下$(".top1div").each(function(){$(this).children().each( alert($(this).attr("id"));); });

空琛琳3007如何用matlab给一堆数据排序,并提取出我需要的数据 -
邬古咐18353777156 ______ 现在假设所有数据在一个n行5列的变量x中数据按顺序列表示“时间,x,y,z,温度”.a=0; for i=1:79 line=find(x(:,5)==i+21); if ~isempty(line) temp=zeros(length(line),4); for j=1:length(line) temp(j, :)=[i+21 x(line(j),2:4)]; end if ~isempty(temp) a=a+1; y(a)={temp}; end end end

空琛琳3007怎么在contig中把基因抠出来 -
邬古咐18353777156 ______ contig就是重叠群的意思.就是基因组分析测序中的一个概念.把含有STS序列标签位点的基因片段分别测序后,重叠分析就可以得到完整的染色体基因组序列.分析中的用到的一个概念就是重叠群.Bioedit提供了本地blast工具(菜单里的local ...

空琛琳3007如何用python语言获得一个字符串的逆序字符串 -
邬古咐18353777156 ______ 1、有时候我们可能想让字符串倒序输出,下面给出几种方法 方法一:通过索引的方法 [python] view plain copy print? >>> strA = "abcdegfgijlk" >>> strA[::-1] 'kljigfgedcba' 方法二:借组列表进行翻转 [python] view plain copy print? #coding=utf-8 ...

空琛琳3007python 如何截取不定长字符串 -
邬古咐18353777156 ______ python的切片操作 [ start : end : step ] step为负的话,倒序,step的绝对值为步进数 以下个人理解,如有误导,请查看官网,以免误人子弟:图2,第三个参数为负数,因此从后往前数,结果与下图一致:12words = "bahsgnepus"print words[:-5:3] words[:-5] --> bahsg 步进为3,故为'b'和's' 如果步进为2的话,则为'b','h','g'

空琛琳3007系统发育树软件谁会??跪求高手 -
邬古咐18353777156 ______ 一、获取序列一般自己通过测序得到一段序列(已知或未知的都可以),通过NCBI的BLAST获取相似性较高的一组序列,下载保存为FASTA格式.用BIOEDIT等软件编辑序列名称,注意PHYLIP在DOS...

空琛琳3007vb中怎么对字符串进行排序? -
邬古咐18353777156 ______ Private Function paixu(ByVal st As String) As String Dim i As Integer, temp As Integer, leng As Integer = Len(st), tempst As String = "" Dim a(leng) As Integer For i = 1 To leng a(i) = Asc(Mid(st, i, 1)) Next i For i = 1 To leng Step 1 For j = 1 To ...

空琛琳3007用MATLAB怎么给一个数组排序? -
邬古咐18353777156 ______ 用sort函数 B=sort(A)这样是默认 第一维(竖着)升序排列 B=sort(A,'descend') 是竖排降序排列 B=sort(A,2,'descend') 是横排降序排列 [B,XI]=sort(A) 是吧排序后的下标存放在XI数组里面

(编辑:自媒体)
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