bioedit序列排序
鞠黎韩2252为什么要进行多序列比对,比对结果可以用于哪些分析 -
纪琦陶13515124506 ______ 多序列比对是成对比对的延伸,是为了在一次比对里面处理多于两条的序列.多序列比对方法试图比对一个指定序列集合里面的所有序列,这可以帮助确定这些序列的共同区段. 常用于研究由共同祖先进化而来的序列,特别是如蛋白质序列或dna序列等生物序列.在比对中,错配与突变相应,而空位与插入或缺失对应.序列比对还可用于语言进化或文本间相似性之类的研究.
鞠黎韩2252如何进行系统进化树的构建和分析? 我这有测好的基因序列,但是不知道该怎么构建系统进化树,求高人指点. -
纪琦陶13515124506 ______ 首先你需要一个能够对序列进行编辑的软件(比如Mac系统的MacGDE、WIndows的BioEdit、Mega、Genuis、ClusterX等)对整个数据库排序(Alignment),就是把相似的位点放到一起去. 同时你要决定构建树用的方法,一般来说用Maximum Likelihood(Paup)、Bayesian(Mr Bayes),不过在此之前先用Neibour-Joining(快速,不准确)看一看大概情况也是必要的 然后就是把数据库里有Gap的部分切掉,然后放到构建树的程序(Paup、MrBayes等)去做树 具体方法见那些软件的说明书……
鞠黎韩2252如何查找基因序列分析软件 -
纪琦陶13515124506 ______ 第1步名单上的必要和最重要的属性,您在基因序列分析软件需要.您可能需要一个方案最好的基因序列比较,基因序列的方法或软件,易于使用的最佳.第3步该网站的搜索基因编码,并审查其“Sequencher”软件程序.这是DNA分析软件.阅读在现场的描述,看看这是您需要的最佳方案.第4步访问该网站DNAstar.com和阅读有关的基因分析产品.这家公司提供了“序列分析的计算机软件”和“序列组装”.您可以要求报价线上.
鞠黎韩2252如何对多序列比对后的结果进行分析 -
纪琦陶13515124506 ______ 首先要把所有的序列复制到windows自带的记事本中,全部以fasta格式存到同一个文件中,保存成*.txt,序列内部最好不要有空格或者换行. 序列格式举例如下: “>序列1 atcg.atcg >序列2 atcg.atcg >序列3 atcg.atcg >序列4 atcg.atcg” 然后用bioedit打开刚才保存的文件*.txt,点击窗口上方的accessory application菜单,再点击clustelw multiple alignment,这时候会弹出一个窗口,直接选择run clustalw,又弹出一个窗口,选择ok,等待结果就行了. 最后的比对结果可以保存成*.fas格式,适用于各种分析.
鞠黎韩2252如何在基因组序列中查找目的基因 -
纪琦陶13515124506 ______ 一:先要知道你要的是什么基因,也就是什么部位的,如线粒体里的等等 二:调取近缘种相关基因的序列. 三:在NCBI里做一个BLAST. 四:选取所要基因的保守序列. 五:在BioEdit生物分析软件里查找所需的DNA序列即可!!!
鞠黎韩2252构建进化树如何选择参比序列?构建进化树如何选择参比序列,可信度太
纪琦陶13515124506 ______ 序列比对建议用ClustalX 建NJ或MP树,用MEGA就可以了,非常方便 若要建ML树推荐用phyML 建Bayes树推荐用Parallel MrBayes @ BioHPC 如果不是专业建树的话,...
鞠黎韩2252如何让excel自动排序 -
纪琦陶13515124506 ______ excel自动排序方法有多种,下面介绍常用的三种排序方式.方法一、Excel自定义排序 设定自己需求的排序方法;现在有一张表,有“日期”和“地点”,希望将“地点”按照方式如:北京、上海、天津、广州,这样来排序;(如下图)1、打...
鞠黎韩2252几种经典排序算法优劣比较的C++程序实现 -
纪琦陶13515124506 ______ 一、低级排序算法1.选择排序 (1)排序过程 给定一个数值集合,循环遍历集合,每次遍历从集合中选择出最小或最大的放入集合的开头或结尾的位置,下次循环从剩余的元素集合中遍历找出最小的并如上操作,最后直至所有原集合元素都遍历...
鞠黎韩2252C++数组排序有哪几种算法? -
纪琦陶13515124506 ______ 插入排序算法 1.从有序数列和无序数列{a2,a3,…,an}开始进行排序; 2.处理第i个元素时(i=2,3,…,n) , 数列{a1,a2,…,ai-1}是已有序的,而数列{ai,ai+1,…,an}是无序的.用ai与ai-1,a i-2,…,a1进行比较,找出合适的位置将ai插入; 3.重复第二...
鞠黎韩2252系统发育树软件谁会??跪求高手 -
纪琦陶13515124506 ______ 一、获取序列一般自己通过测序得到一段序列(已知或未知的都可以),通过NCBI的BLAST获取相似性较高的一组序列,下载保存为FASTA格式.用BIOEDIT等软件编辑序列名称,注意PHYLIP在DOS...