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多序列比对方法

来源:baiyundou.net   日期:2024-09-24

石屈行3918如何对多序列比对后的结果进行分析 -
松董莎13518696132 ______ 首先要把所有的序列复制到windows自带的记事本中,全部以fasta格式存到同一个文件中,保存成*.txt,序列内部最好不要有空格或者换行. 序列格式举例如下: “>序列1 atcg.atcg >序列2 atcg.atcg >序列3 atcg.atcg >序列4 atcg.atcg” 然后用bioedit打开刚才保存的文件*.txt,点击窗口上方的accessory application菜单,再点击clustelw multiple alignment,这时候会弹出一个窗口,直接选择run clustalw,又弹出一个窗口,选择ok,等待结果就行了. 最后的比对结果可以保存成*.fas格式,适用于各种分析.

石屈行3918如何比较两列数据的重叠和差异?有两列数据,如何分别找出A列有B列无、B列有A列无以及两列都有的数据呢?请看下列多种方法,总有一种适合你!方法... -
松董莎13518696132 ______[答案] 方法四:数组公式,需要按三键回车然后下拉.C2公式:=INDEX(A:A,SMALL(IF(COUNTIF(B$2:B$105,A$2:A$187),4^8,ROW($2:$187)),ROW(A1)))&""D2公式:=INDEX(B:B,SMALL(IF(COUNTIF(A$2:A$187,B$2:B$105),4^8,ROW($2:$105)...

石屈行3918想问下各位高人,设计引物时没有所找物种的基因序列,想问下怎么进行多物种序列比对,找到相对保守区域呢
松董莎13518696132 ______ 找近缘种,越近越好,的那个基因 都下下来 ncbi或软件都可以比对,找高度保守区 具体操作为,蛋白序列和DNA序列都下,从连着7-8个蛋白保守区处比着DNA设计引物, 如果有四个是G,两个是A就选G, 要是一半一半就设计简并引物. 一个引物简并引物不能超过3个!

石屈行3918如何在ncbi中比对两个序列的同源性 -
松董莎13518696132 ______ 你在用DNAMAN的多序列比对时,在弹出的对话框中可能没有选择“尝试使用双链”吧?包括编码链和非编码连的比对,你测序得到的目的片段可能是非编码链(即你目的基因的编码链的互补序列),而NCBI中提交的序列都是编码链的序列.

石屈行3918分子生物学中,怎样进行多序列比对?【详细些】NCBI仅提供了2条序列的比对. -
松董莎13518696132 ______ 用MACAW2.05软件进行多序列同源性比较

石屈行3918基因序列比较怎么分析? -
松董莎13518696132 ______ 看你是要对比几条序列了,双序列比对需要BLAST,NCBI上有,也可以在百度搜索本地版的下载下来,多序列比对需要cluxtal X软件, 要把所有基因序列fasta格式放在一起,需要输入所有序列的fasta格式,然后进行多序列联配!

石屈行3918怎么做序列比对啊,怎么做基因查找呢,找到以后要用那部分呢?我目前?
松董莎13518696132 ______ 找基因的话从NCBI.打开NCBI主页,右上方有个可选框,即可查找.序列比对的话可以用DNASTAR软件.挺好用的.

石屈行3918序列比对可以揭示哪些序列特征,可开展哪些方面的分析. -
松董莎13518696132 ______ 序列比对通过比较生物分子序列,发现它们的相似性,找出序列之间共同的区域,同时辨别序列之间的差异,从而揭示生物序列的功能、结构和进化的信息.最常见的比对是蛋白质序列之间或核酸序列之间的两两比对,通过比较两条序列之间的相似区域和保守性位点,寻找二者可能的分子进化关系.还可以对多条蛋白质或核酸序列同时进行比较,寻找这些有进化关系的序列之间共同的保守区域、位点和概型,从而探索导致它们产生共同功能的序列模式.此外,还可以通过比较蛋白质序列和核酸序列相比来探索核酸序列可能的表达框架;把蛋白质序列与已知三维结构信息的蛋白质相比,从而获得蛋白质折叠类型的信息.

(编辑:自媒体)
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