序列比对怎么做
翟斧滢4036如何用clustalx做序列同源比对后的结果图 -
戈很固19144901026 ______ 多序列比对在分子生物学中是一个基本方法,用来发现特征序列,进行蛋白分类,证明序列间的同源性,帮助预测新序列二级结构与三级结构,确定PCR引物,以及在分子进化分析方面均有很大帮助,Clustal W(Dos版本)很适合这些方面的要求,Clustal X是window版本. 用Clustal比对后的序列,有时候我们需要转为图片放在文章作详细方析,但大部分人的方法都是直接截图,这样的后果就是图片一点都不美观.如果你是想要发表文章或其它比较重要的用途,图片的质量还是需要高一点的.
翟斧滢4036如何进行两蛋白质序列比对? -
戈很固19144901026 ______ clustal x 可以做全序列比对 如果要做进化树 再用MEGA4.0
翟斧滢4036怎么用一个核苷酸序列与多个核苷酸序列进行比对 -
戈很固19144901026 ______ 用DNAStar软件里面的MegAlign就可以进行比对
翟斧滢4036怎么进行核酸序列比对? -
戈很固19144901026 ______ 容易了,我每天都在做这个 上NCBI的blast http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/seq/BlastGen/BlastGen.cgi?taxid=4530 把你的序列拷贝过去, Database:这个选Refseq RNA,其它参数默认.. 你肯定没有选择数据库,是在水稻的全基因组里搜索了,因为NC_008397是chromosome 4的全长序列.. 不懂你再call我......另,在Tiger上的分析还不如NCBI..其实结果是一样的.
翟斧滢4036序列比对的算法有哪些?在应用上各有何特点 -
戈很固19144901026 ______ 首先你要明白——Clustalx的多序列比对算法是基于双序列比对的,它先将所有序列两两比对,然后根据两两比对结果构建指导树,再根据指导树依次添加相似度最高的
翟斧滢4036怎样进行局部比对 生物信息学 -
戈很固19144901026 ______ BLAST 可以进行两序列,也可以进行多序列比对.你可以查一下,在NCBI上可以在线BLAST.建议你先借几本生物信息学方面的书了解一下.
翟斧滢4036生命科学里的序列blast是什么意思blast的概念和操作流程及?
戈很固19144901026 ______ BLAST (Basic Local Alignment Search Tool)是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具.BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较....
翟斧滢4036同一种酶不同物种中的基因如何进行多序列比对? -
戈很固19144901026 ______ 你所做的工作应该是寻找某个物种中的某一个基因在其它物种中的同源基因(ortholog)然后再做进化树那种吧.进行多序列比对有许多软件都可以做到,DNAman我用的比较多的是alignment而不是multisequence alignment.给你推荐一些软件,一个是clustalx,一个是MEGA,这两个软件都可以进行蛋白多序列比对,而后者我认为更强大些,还可以进行进化树分析.把你所有从NCBI上找到的CDS导入到软件中(一般做同源分析都是用蛋白质序列).然后用软件进行比对就可以了,结果可以输出为多种形式,比如fasta或者其它格式,软件用法我这里也不多讲了,必须看专用的手册.如果还有不明白就发信息给我
翟斧滢4036如何对多序列比对后的结果进行分析 -
戈很固19144901026 ______ 首先要把所有的序列复制到windows自带的记事本中,全部以fasta格式存到同一个文件中,保存成*.txt,序列内部最好不要有空格或者换行. 序列格式举例如下: “>序列1 atcg.atcg >序列2 atcg.atcg >序列3 atcg.atcg >序列4 atcg.atcg” 然后用bioedit打开刚才保存的文件*.txt,点击窗口上方的accessory application菜单,再点击clustelw multiple alignment,这时候会弹出一个窗口,直接选择run clustalw,又弹出一个窗口,选择ok,等待结果就行了. 最后的比对结果可以保存成*.fas格式,适用于各种分析.
翟斧滢4036序列比对可以揭示哪些序列特征,可开展哪些方面的分析. -
戈很固19144901026 ______ 序列比对通过比较生物分子序列,发现它们的相似性,找出序列之间共同的区域,同时辨别序列之间的差异,从而揭示生物序列的功能、结构和进化的信息.最常见的比对是蛋白质序列之间或核酸序列之间的两两比对,通过比较两条序列之间的相似区域和保守性位点,寻找二者可能的分子进化关系.还可以对多条蛋白质或核酸序列同时进行比较,寻找这些有进化关系的序列之间共同的保守区域、位点和概型,从而探索导致它们产生共同功能的序列模式.此外,还可以通过比较蛋白质序列和核酸序列相比来探索核酸序列可能的表达框架;把蛋白质序列与已知三维结构信息的蛋白质相比,从而获得蛋白质折叠类型的信息.