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怎么用ncbi比对测序结果

来源:baiyundou.net   日期:2024-09-24

融周榕2000NCBI进行blast对乳酸菌16s鉴定,能给出详细操作步骤吗? -
官陶之19889134592 ______ 登陆 NCBI homepage,点击 blast,然后点击nucleotide blast,在弹出的网页上Enter Query Sequence中粘贴你测序的序列.在Choose Search Set一项中,选others...

融周榕2000NCBI使用问题. 我是初学者,想知道用NCBI怎么查dna、rna的全部序列啊??
官陶之19889134592 ______ 查mRNA的话,在NCBI主页上All Databases下拉框处选择Neucleotide,在右侧搜索框里填上你想搜的基因的名字就OK了,得到的就是你这个基因在不同物种里面的序列,在新页面右侧Top Organisms中可以看到在某个物种里面共提交了共多少条序列. 查DNA的话,在NCBI主页上ALL Databases下拉框处选择Gene就可以了.

融周榕2000测序结果如何知道是不是自己想要的目的片段,如何比较!
官陶之19889134592 ______ 对于测序结果您首先应核对的载体是否正确,其次是您克隆之前PCR特异性引物是否能找到,如果这两个条件满足的话,就可以确认是您的东西了. 至于插入片段是否与您预期的一致,那么可以在NCBI中将测序结果与您的目的序列进行BLAST比对,看匹配度;也可以在一些比对软件中,例如“DNASTAR”等中进行拼接比对.

融周榕2000如何进行DNA的结构分析
官陶之19889134592 ______ 如何测序的?是连接上了质粒么?如果有质粒的序列,先在NCBI上把质粒序列查出来.具体网址是http://www.ncbi.nlm.nih.gov/VecScreen/VecScreen.html 时候它会显示出质粒的序列. 然后把去除质粒的剩余序列用NCBI检索啊. http://blast.ncbi...

融周榕2000怎样用NCBI在一个特定全测序基因组里面查找一个特定的基因?比如在杨树基因组里面查找AP1这个基因
官陶之19889134592 ______ 如果你知道编号就更好了,现在AP1 结果又245个,我对杨树不熟悉,需要你自己筛选.首先进入http://www.ncbi.nlm.nih.gov/之后再左边有个GENE,点击它,进入基因主页http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/然后在Find genes by...找gene name (symbol)这一项,进入按照基因名称检索界面好运.

融周榕2000用什么软件可以确定我得基因序列和已知的基因序列的 -
官陶之19889134592 ______ 在线可以比对.在ncbi网站上找blast,然后选N blast 就是核酸blast,再然后看到有个框 输入你的序列 点下面的√ 又会出来个框 输入已知序列,最后 点blast就知道相似度多少了

融周榕2000如何使用ncbi核苷酸blast -
官陶之19889134592 ______ Blast(Basic Local Alignment Search Tool)是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具.BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较.BLAST结果中的得分是对一种对相似性的统计说明. BLAST 采用...

融周榕2000如何使用ncbi查找某一基因的dna序列 -
官陶之19889134592 ______ 打开NCBI的首页,在下拉菜单中选中gene,输入你需要找的基因的名称,点击搜索就可以了

融周榕2000从NCBI怎么调取已知酶的RNA序列 有什么软件对几种RNA序列进行对比 -
官陶之19889134592 ______ 从NCBI怎么调取已知酶的RNA序列:1:NCBI上一般是DNA或者cDNA,你可以先下载DNA,然后通过DNAstar中的EIDTseq转化为RNA.2:可以通过上述RNA直接试试用BLAST检索到其他相关的RNA.3:试用DNAstar中的ALIGN进行序列比对.

融周榕2000怎样在NCBI上查找基因的cDNA序列 -
官陶之19889134592 ______ 在NCBI主页上方search栏左边有一个database选择框,点击下拉三角形选择nucleotide(如图红框)在search栏输入基因名搜索即可. 以人的orc1基因为例, 在搜索结果中选择mRNA和complete cds序列的结果都可以,如下 点击进入序列文件查看详情,以上图搜索结果18为例,点开后界面如下 向下找到cds标签 点击CDS跳出如下界面 棕色标记的序列就是cDNA序列,旁边有对应的氨基酸序列. 如果搜索结果太多,可以在检索结果中按物种筛选,如下图红框. 以上即是基本步骤.

(编辑:自媒体)
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