如何用ncbi查找并比对蛋白序列

邱典竖4980NCBI如何查蛋白质的结构域?比如我想搜索人类蛋白质中具有ABC结构域的蛋白,在structure里面输入什么? -
冯凌褚19122353724 ______ 真有叫ABC的结构域呀... 在structure里输入 (＂ABC＂[PDB Description]) AND ＂homo sapiens＂[Organism] 试试看是不是你要的. 关键词比较多,最好用Advanced Search. 回复 沧海蓝天★:description 是对结构的描述信息,你说的...

邱典竖4980我想找某基因的保守序列,不知怎么找,无从下手?急用,请指点? -
冯凌褚19122353724 ______ 在NCBI或GENEBANK上至少找10个序列,用分子生物学软件align 一下,就可以找到保守序列.我找HIV-1的保守序列就是这么做的,设计的引物基本上都扩出来了.试试看.

邱典竖4980如何使用ncbi核苷酸blast -
冯凌褚19122353724 ______ Blast(Basic Local Alignment Search Tool)是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具.BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较.BLAST结果中的得分是对一种对相似性的统计说明. BLAST 采用...

邱典竖4980测了基因序列,想与已知序列进行比较,不知道怎样找到这些序列的GenBank号 -
冯凌褚19122353724 ______ 直接上ncbi中的blast比对就行了.比对结果会出现最相似序列的登录号和序列信息.

邱典竖4980求助,有没有知道怎么用NCBI查基因序列,谢谢 -
冯凌褚19122353724 ______ www.pubmed.gov 搜索框的下拉菜单选Nucleotide,框中输入基因名,点击Search,或按Enter键.

邱典竖4980NCBI操作:获取一段真核基因序列并获得其内含子外显子的位置 -
冯凌褚19122353724 ______ 现 输入ABL[sym] 代表查找ABL缩写符号基 /?term=ABL[sym] 第类ABL基再点 /25 该基位于第9号染色体130713881..130887675 拉第三栏灰色条Genomic regions, transcripts, and products点击偏右侧Go to nucleotide: GenBank 向拉看 gene 1..173795说该基全 mRNA, 看11段数值该基11外显位置同理CDs11外显编码区域 具体序列面根据数值段

邱典竖4980怎么在NCBI中找某物种的CPG岛总数我做的大鼠,想知道大鼠的全
冯凌褚19122353724 ______ 1.即先找着该基因的mRNA序列,然后再根据此找其DNA序列,都找到后,相对应mRNA序列ATG之前的2000个DNA碱基序列即为启动子区域.如果没有自动将之区分显示出来的网站或工具,我们可能的方法就是将mRNA和DNA进行手动比对,比如说blast或clustawl等,但我发给你的那个网站有这个功能,不需要手动比较了,基本方法和我发给你的那份资料差不太多.当然也和楼上那位仁兄说的一样,也要用到ensembl 2.找到了该启动子区域后,下一步要做的就是对该区域进行反式转录因子结合部位,也就是顺式作用元件就行分析.这有专门的工具和网站.

邱典竖4980如何查找基因之间相互作用的数据库 -
冯凌褚19122353724 ______ 在NCBI主页上方search栏左边有一个database选择框,点击下拉三角形选择nucleotide(如图红框)在search栏输入基因名搜索即可.以人的orc1基因为例,在搜索结果中选择mRNA和complete cds序列的结果都可以,如下点击进入序...

邱典竖4980如何通过生物信息学手段确定基因组中编码序列,非编码序列 -
冯凌褚19122353724 ______ 这个可以用NCBI的数据库进行查询. 1、可以直接进行Blast序列比对,在数据库中进行比对. 2、采用ORF Finding,可以对编码区进行预测.

邱典竖4980如何查找一个基因的启动子序列 -
冯凌褚19122353724 ______ 定义:启动子是参与特定基因转录及其调控的DNA序列.包含核心启动子区域和调控区域.核心启动子区域产生基础水平的转录,调控区域能够对不同的环境条件作出应答,对基因的表达水平做出相应的调节.区域:启动子的范围非常大,可以...