ncbi多序列序列比对

沈媛琬3523分子生物学中,怎样进行多序列比对?【详细些】NCBI仅提供了2条序列的比对. -
居巩悦17097267569 ______ 用MACAW2.05软件进行多序列同源性比较

沈媛琬3523基因序列比较怎么分析? -
居巩悦17097267569 ______ 看你是要对比几条序列了,双序列比对需要BLAST,NCBI上有,也可以在百度搜索本地版的下载下来,多序列比对需要cluxtal X软件, 要把所有基因序列fasta格式放在一起,需要输入所有序列的fasta格式,然后进行多序列联配!

沈媛琬3523我想要应用NCBI的BLAST找到人和鼠的MyD88氨基酸序列,并比较它们之间的同源性,想请教您 -
居巩悦17097267569 ______ 1 进入NCBI首页http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 2 蛋白库中输入MyD88,可找到人和鼠的MyD88, 人(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/AAC50954.1), 小鼠(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/AAC53013.1) 3 可以下载序列用软件做本地比对...

沈媛琬3523细菌16S rDNA 序列比对,谢谢 -
居巩悦17097267569 ______ 这么说吧,NCBI是个乱七八糟的地方,很多序列是不可信的.你只看匹配率就行了,其他不用管.比如我分离得到的一个新的细菌,比对之后发现最相近的是是E.coli,但是其实相似度最高也不过92%,换句话说,我分离得到的这个细菌根本不...

沈媛琬3523关于已知DNA序列在NCBI上比对并鉴定菌种 -
居巩悦17097267569 ______ 用contig 1软件将上述两段序列拼接后,用拼接结果的反向互补序列进行BLAST.BLAST结果显示,你的菌株与动物乳杆菌,鼠乳杆菌,乳酸乳球菌Max ident均为96%.

沈媛琬3523测了基因序列,想与已知序列进行比较,不知道怎样找到这些序列的GenBank号 -
居巩悦17097267569 ______ 直接上ncbi中的blast比对就行了.比对结果会出现最相似序列的登录号和序列信息.

沈媛琬3523怎么做序列比对啊,怎么做基因查找呢,找到以后要用那部分呢?我目前?
居巩悦17097267569 ______ 找基因的话从NCBI.打开NCBI主页,右上方有个可选框,即可查找.序列比对的话可以用DNASTAR软件.挺好用的.

沈媛琬3523同一种酶不同物种中的基因如何进行多序列比对? -
居巩悦17097267569 ______ 你所做的工作应该是寻找某个物种中的某一个基因在其它物种中的同源基因(ortholog)然后再做进化树那种吧.进行多序列比对有许多软件都可以做到,DNAman我用的比较多的是alignment而不是multisequence alignment.给你推荐一些软件,一个是clustalx,一个是MEGA,这两个软件都可以进行蛋白多序列比对,而后者我认为更强大些,还可以进行进化树分析.把你所有从NCBI上找到的CDS导入到软件中(一般做同源分析都是用蛋白质序列).然后用软件进行比对就可以了,结果可以输出为多种形式,比如fasta或者其它格式,软件用法我这里也不多讲了,必须看专用的手册.如果还有不明白就发信息给我

沈媛琬3523想问下各位高人,设计引物时没有所找物种的基因序列,想问下怎么进行多物种序列比对,找到相对保守区域呢
居巩悦17097267569 ______ 找近缘种,越近越好,的那个基因 都下下来 ncbi或软件都可以比对,找高度保守区 具体操作为,蛋白序列和DNA序列都下,从连着7-8个蛋白保守区处比着DNA设计引物, 如果有四个是G,两个是A就选G, 要是一半一半就设计简并引物. 一个引物简并引物不能超过3个!

沈媛琬3523序列比对的基本原则是什么 -
居巩悦17097267569 ______ 序列比对[1] 是生物信息学[2] 的基本组成和重要基础.序列比对的基本思想是,基于生物学中序列决定结构,结构决定功能的普遍规律,将核酸序列和蛋白质一级结构上的序列都看成由基本字符组成的字符串,检测序列之间的相似性,发现生物...