ncbi如何进行序列比对

邢生袁1576用什么软件可以确定我得基因序列和已知的基因序列的 -
通知盛13318062956 ______ 在线可以比对.在ncbi网站上找blast,然后选N blast 就是核酸blast,再然后看到有个框 输入你的序列 点下面的√ 又会出来个框 输入已知序列,最后 点blast就知道相似度多少了

邢生袁1576怎样在NCBI进行相似性搜索?(最好有例子图片) -
通知盛13318062956 ______ 要做相似性搜索,需要用到blast(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)在线比对工具. 如果有一条DNA序列,可以做blastn,blastx,tblastx比对;寻找和此DNA相似性高的DNA或蛋白质. 如果有一条蛋白质序列,可以做blastp,tblastn比对,寻找和此蛋白质相似性较高的蛋白质或DNA. 图示blastp

邢生袁1576测了基因序列,想与已知序列进行比较,不知道怎样找到这些序列的GenBank号 -
通知盛13318062956 ______ 直接上ncbi中的blast比对就行了.比对结果会出现最相似序列的登录号和序列信息.

邢生袁1576如何在NCBI实现大批量数据的一一对应 -
通知盛13318062956 ______ 先来讲讲NCBI的.用FTP登陆ftp.ncbi.nih.gov(windows下可以直接打开或是用迅雷/Flastget等下载工具).cd gene/DATA(windows下依次找到gene/DATA这个文件夹).ls一下,里面的文件大概有:ncftp /gene/DATA > ls ASN_BINARY/ gene2sts ...

邢生袁1576我想要应用NCBI的BLAST找到人和鼠的MyD88氨基酸序列,并比较它们之间的同源性,想请教您 -
通知盛13318062956 ______ 1 进入NCBI首页http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 2 蛋白库中输入MyD88,可找到人和鼠的MyD88, 人(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/AAC50954.1), 小鼠(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/AAC53013.1) 3 可以下载序列用软件做本地比对...

邢生袁1576如何查找基因序列 NCBI 快速找到答案 -
通知盛13318062956 ______ 在NCBI主页上方search栏左边有一个database选择框,点击下拉三角形选择nucleotide(如图红框)在search栏输入基因名搜索即可.以人的orc1基因为例,在搜索结果中选择mRNA和completecds序列的结果都可以,如下点击进入序列文件查看详情,以上图搜索结果18为例,点开后界面如下向下找到cds标签点击CDS跳出如下界面棕色标记的序列就是cDNA序列,旁边有对应的氨基酸序列.如果搜索结果太多,可以在检索结果中按物种筛选,如下图红框.以上即是基本步骤.

邢生袁1576生命科学里的序列blast是什么意思blast的概念和操作流程及?
通知盛13318062956 ______ BLAST (Basic Local Alignment Search Tool)是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具.BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较....

邢生袁1576如何通过生物信息学手段确定基因组中编码序列,非编码序列 -
通知盛13318062956 ______ 这个可以用NCBI的数据库进行查询. 1、可以直接进行Blast序列比对,在数据库中进行比对. 2、采用ORF Finding,可以对编码区进行预测.

邢生袁1576想问下各位高人,设计引物时没有所找物种的基因序列,想问下怎么进行多物种序列比对,找到相对保守区域呢
通知盛13318062956 ______ 找近缘种,越近越好,的那个基因 都下下来 ncbi或软件都可以比对,找高度保守区 具体操作为,蛋白序列和DNA序列都下,从连着7-8个蛋白保守区处比着DNA设计引物, 如果有四个是G,两个是A就选G, 要是一半一半就设计简并引物. 一个引物简并引物不能超过3个!

邢生袁1576怎样确认ncbi上公布的序列是不是被公认的 -
通知盛13318062956 ______ ncbi上的序列没有公不公认这一说法,只要你按照正规的手续提交,都可以将自己的序列提交到ncbi上.由于ncbi上的数据信息是海量的,没有人愿意一个个检查你的序列的来源是否准确,而且这也是在现实中做不到的.ncbi只能确保该序列提...