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ncbi如何进行blast

来源:baiyundou.net   日期:2024-09-24

令光尝3803如何在NCBI上得到猪的CDS序列 -
钱贤码19481421776 ______ 进行CDS分析,首先要有一段氨基酸序列(基因序列要转换成氨基酸序列),在NCBI首页上第二排链接里点BLAST,进入BLAST页面,在BLAST页面最下方的Specialized BLAST里的第三个链接(Find conserved domains in your sequence (cds))就是CDS分析,输入你的氨基酸序列,就会显示相应的结果.

令光尝3803在NCBI中怎么用已知的引物找目的基因(微生物) -
钱贤码19481421776 ______ 在NCBI中需要选核算那个选项,然后写出微生物英文缩写名称,另外最好写上该基因片段名称.点击搜索即可.会搜到很多基因,找几个典型的基因,然后复制到txt文档里,用DNAStar的editseq来查询已知引物所在位置.不懂继续问.还望采纳哈~

令光尝3803我现在有一物种的引物序列,想通过引物在NCBI中找到它的登陆号,不知道怎样才能找到?谢谢 -
钱贤码19481421776 ______ 在NCBI中BLAST引物(注意选择BLAST的数据库),然后再Blast结果中找寻符合要求的序列.后面会列出很多链接,直接就能看到NCBI号 进入http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/Blast.cgi?PAGE=Nucleotides&PROGRAM=blastn&...

令光尝3803如何用pubmed的blast核对引物 -
钱贤码19481421776 ______ 先打开ncbi,再打开blast,然后在Nucleotide一栏找到Nucleotide-Nucleotide blast,然后在出来的网页中把你的上游或者下游引物序列输入后,选择人还是鼠的或是其他,点BLAST即可,再出...

令光尝3803可否介绍一下ncbi中blast的用法,详细点 -
钱贤码19481421776 ______ 先到: http://130.14.29.110/BLAST/index.shtml 选择 Nucleotide-nucleotide BLAST (blastn) 然后在Search旁边那个大方框里填你要寻找的序列,然后点 BLAST! 然后按 Format! 这时会弹出一个新的窗口,慢慢等个十几秒几十秒……出来的结果会将找到的序列按是否接近排列出来.点最左边一栏(例:gi|114690489|ref|XR_025388.1|)的话会给你看找到的序列的详细介绍,而如果点Score bits下面的数字就可以看见你输入的序列和他们在数据库找到的序列的对比.上面Query一行是你输入的,下面Sbjct是数据库里的序列.

令光尝3803知道actin引物序列怎么查片段大小 -
钱贤码19481421776 ______ 进入NCBI网站,点击BLAST,输入一段引物序列,进行BLAST,会得到一些与之匹配的基因;然后再用另一段引物序列进行BLAST.比较两次结果,找到引物所匹配的基因,BLAST的时候会告诉你...

令光尝3803我有一个基因序列 如何使用ncbi的blast查询
钱贤码19481421776 ______ 你登录他的网站,在nucleatide里面blast 就可以了

令光尝3803NCBI的Primer - BLAST怎么用 -
钱贤码19481421776 ______ rimer-BLAST的输入Primer-BLAST界面包括了Primer3和BLAST的功能.提交的界面主要包括三个部分:targettemplate(模板区),theprimers(引物区),和specificitycheck(特异性验证区).跟其它的BLAST一样,点击底部的“...

令光尝3803如何查找一个基因附近的其他基因?请详细介绍步骤. -
钱贤码19481421776 ______ 上NCBI做BLAST,确定你的目的基因位于哪个染色体的什么区域.上NCBI查找该染色体该区域附近有什么基因.

令光尝3803blast nt nr 选哪个 -
钱贤码19481421776 ______ ncbi主页 进入 blast 进入 nucleotide blast 将序列粘入窗口中 选择nucleotide cllection(nr/nt)选项 进行比对就可以了 出来的序列相似性最高的就是你的目的序列

(编辑:自媒体)
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