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dnaman多序列比对

来源:baiyundou.net   日期:2024-09-24

靳钥弯2838用DNAMAN软件怎样分析一段已知序列属于哪个基因 -
洪元震17865088398 ______ 如果你已知一些基因的序列,可以用DNAMAN 比对,如果不知道,就要从NCBI上查.

靳钥弯283816s测通序列无法拼接,有没有好的方法和软件可以帮忙? -
洪元震17865088398 ______ DNAMAN足矣,你把测通的各个序列片段进行比对,然后就会交错重叠,通过这些东西进行拼接即可.

靳钥弯2838请问在PCR实验中,如果不知道模板DNA的核酸序列的情况下如何设计PCR引物?最近一直在学PCR. -
洪元震17865088398 ______[答案] 一般来说,RT-PCR的时候很多情况下会不知道模板DNA的序列,可以在Genbank中寻找和你要扩增的物种的亲缘关系较近的物种的同源基因,多找几种,用DNAMAN或其他软件可以比对它们的序列,这样可以得出这种基因在进化过程中的保守序列...

靳钥弯2838什么是引物? -
洪元震17865088398 ______ [编辑本段]概念 引物,是一小段单链DNA或RNA,作为DNA复制的起始点,在核酸合成反应时,作为每个多核苷酸链进行延伸的出发点而起作用的多核苷酸链,在引物的3′-OH上,核苷酸以二酯链形式进行合成,因此引物的3′-OH,必须是游离...

靳钥弯2838在NCBI上搜索不同物种的同一基因有什么样的作用?
洪元震17865088398 ______ 在NCBI上搜索不同物种的同一基因,通过序列分析软件(比如DNAman)比对(Alignment),各基因相同的序列就是该基因的保守区

靳钥弯2838请问拿到测序的结果,怎么找不到引物序列? -
洪元震17865088398 ______ 你应该在DNAMan上进行比对,看引物能不能比对上(一个不变,一个反向互补),如果比不上,那可能就不是你要的序列,如果能比上,上游以引物第一个为分界线,去除前面的;下有一最后一个为分界线,去除后面的,剩下的就是目的序列.

靳钥弯2838如何使用DNAMAN软件构建ORF图
洪元震17865088398 ______ 通过 Restriction/Draw map 命令打开质粒绘图界面:将鼠标移动到圆圈上,等鼠标变形成“I”时,单击鼠标左键,出现如下菜单:菜单说明如下:Position 当前位置 Add Site 添加酶切位点 Add Element 添加要素 Add Text 添加文字 Insert ...

靳钥弯2838请问在PCR实验中,如果不知道模板DNA的核酸序列的情况下如何设计PCR引物?求高手给出具体步骤啊
洪元震17865088398 ______ 一般来说,RT-PCR的时候很多情况下会不知道模板DNA的序列,可以在Genbank中寻找和你要扩增的物种的亲缘关系较近的物种的同源基因,多找几种,用DNAMAN或其他软件可以比对它们的序列,这样可以得出这种基因在进化过程中的保守序列,根据这个保守序列设计引物来PCR,扩增出来的机率就大多了.

靳钥弯2838如何确定核苷酸序列的保守区域 -
洪元震17865088398 ______ 因为保守序列在很多近缘的物种中都是一样的. 如果是要寻找保守序列,可以先选择几个亲缘关系较近的物种,如同一科或属的其它物种.然后进行多序列比对,可利用DNAMAN或DNASTAR等生物信息学软件.相同的序列片断即有可能是保守序列. 也可以先查找相关文献,看看是否已有人研究过同样或类似物种的保守序列.

(编辑:自媒体)
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