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dnaman批量比对

来源:baiyundou.net   日期:2024-09-24

都狮泪4821ncbi上的blast序列比对工具怎么使用,求具体操作指南. -
褚苛洁15870568227 ______ 1)输入fasta格式序列 2)选择核算比对

都狮泪4821如何使用DNAMAN软件构建ORF图
褚苛洁15870568227 ______ 通过 Restriction/Draw map 命令打开质粒绘图界面:将鼠标移动到圆圈上,等鼠标变形成“I”时,单击鼠标左键,出现如下菜单:菜单说明如下:Position 当前位置 Add Site 添加酶切位点 Add Element 添加要素 Add Text 添加文字 Insert ...

都狮泪4821怎样使用dnaman绘制线性基因测序图
褚苛洁15870568227 ______ 看软件help 简单说测序序列打开找翻译atg起始终止密码子copy新空白文档load该文档channel点击protein栏translation有啦 比对要比序列分别load每channel点击sequence-allignment看比对结了

都狮泪4821第一个文件是基因名称,第二个文件包括基因名和基因序列,需要根据第一个文件的基因名提取基因序列 -
褚苛洁15870568227 ______ DNAMAN比对可以确定两者同源性,也就是说这样可以知道第一个文件中的序列在第二个文件的位置和一些相关信息.如果有担心遗漏的话DNASTAR等软件搜索CDS然后在NCBI上比对一下就可以大体上知道是那些基因,当然如果该基因未被研究并标记的话就查不到了.如果是基因组学或者转录组学方法的数据结果的话也有专门的软件支持,只是不太明白你的数据是如何得出的,文库?转录组?重测序?你要做的是基因注释还是就分类呢?

都狮泪4821用DNAMAN软件怎样分析一段已知序列属于哪个基因 -
褚苛洁15870568227 ______ 如果你已知一些基因的序列,可以用DNAMAN 比对,如果不知道,就要从NCBI上查.

都狮泪4821从NCBI怎么调取已知酶的RNA序列 有什么软件对几种RNA序列进行对比 -
褚苛洁15870568227 ______ 从NCBI怎么调取已知酶的RNA序列:1:NCBI上一般是DNA或者cDNA,你可以先下载DNA,然后通过DNAstar中的EIDTseq转化为RNA.2:可以通过上述RNA直接试试用BLAST检索到其他相关的RNA.3:试用DNAstar中的ALIGN进行序列比对.

都狮泪4821请问拿到测序的结果,怎么找不到引物序列? -
褚苛洁15870568227 ______ 你应该在DNAMan上进行比对,看引物能不能比对上(一个不变,一个反向互补),如果比不上,那可能就不是你要的序列,如果能比上,上游以引物第一个为分界线,去除前面的;下...

都狮泪4821克隆测序结果找不到目的片段的引物序列 -
褚苛洁15870568227 ______ 不要试图找克隆序列的引物序列,找到克隆载体的连接位点前后去掉就可以了,中间就是你插入的序列,或者直接用DNAstar选择哪个载体直接去掉载体污染也行!

都狮泪4821分子生物学实验中有哪些常用的软件 -
褚苛洁15870568227 ______ 首先就是primer5了,主要是用来设计引物的,这个应该是分子生物学的最近本的了.上个界面图.想要具体教程的话可以私信我.还有一个很重要的软件就是invitrogen公司的vector nti advanced 11软件了,里面的东西比价多,简单的序列比对,质粒图的查看和编辑等等的.上图还有一些生物信息学的软件偏向高级的. 蛋白质互作网络分析-cytoscape 文献管理的软件我习惯用endnote

都狮泪4821如何在NCBI中进行基因序列比对,比如小鼠p53基因与人类p53基因的比对 -
褚苛洁15870568227 ______ 首先找到小鼠和人类p53基因的序列,然后进ncbi首页,里面靠右的位置popular resources下第一个选项“blast”,打开以后,找“nucleotide blast”.进到那个页面有个框就是让你输序列的,如果要比对两个序列的话,要勾选下面的一个小的单选框“Align two or more sequences ”.就会出现两个框,分别输入人和小鼠的序列.点最下面大大的“blast”按钮,就可以了. 希望对你有帮助,欢迎追问~

(编辑:自媒体)
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