dnaman多条序列比对

易虹苛324916s测通序列无法拼接,有没有好的方法和软件可以帮忙? -
全注柳15050953553 ______ DNAMAN足矣,你把测通的各个序列片段进行比对,然后就会交错重叠,通过这些东西进行拼接即可.

易虹苛3249用DNAMAN软件怎样分析一段已知序列属于哪个基因 -
全注柳15050953553 ______ 如果你已知一些基因的序列,可以用DNAMAN 比对,如果不知道,就要从NCBI上查.

易虹苛3249基因序列比较怎么分析? -
全注柳15050953553 ______ 看你是要对比几条序列了,双序列比对需要BLAST,NCBI上有,也可以在百度搜索本地版的下载下来,多序列比对需要cluxtal X软件, 要把所有基因序列fasta格式放在一起,需要输入所有序列的fasta格式,然后进行多序列联配!

易虹苛3249请问在PCR实验中,如果不知道模板DNA的核酸序列的情况下如何设计PCR引物?最近一直在学PCR. -
全注柳15050953553 ______[答案] 一般来说,RT-PCR的时候很多情况下会不知道模板DNA的序列,可以在Genbank中寻找和你要扩增的物种的亲缘关系较近的物种的同源基因,多找几种,用DNAMAN或其他软件可以比对它们的序列,这样可以得出这种基因在进化过程中的保守序列...

易虹苛3249如何进行基因序列分析,有什么软件吗? -
全注柳15050953553 ______ 你去ncbi吧,上面可以进行DNA序列的分析,我们一般分析启动子上又什么元件啊之类的都在上面,不过你可能需要让他人教一下才会用的.

易虹苛3249设计引物的时候,我比对氨基酸序列,由于保守性很高,老师让我用核苷酸序列比对. -
全注柳15050953553 ______ 要设计简并引物是么? 最好还是使用CDS序列来做比对,然后根据保守区设计简并引物,CDS两端的非翻译区在物种间变化太大,不适合设计引物. 把获得各个物种的CDS做成fasta格式的,序列最好处理成纯序列格式的不含其它任何字符.然后用比对软件比对一下,如mega,DNAman或者是vector NTI里的比对工具都可以做比对. 在比对结果里找到非常保守的区域就可以设计简并引物了. 设计的简并引物可以根据经验公式自个算Tm值.不用计较打分的问题.因为你只能在保守区设计引物. 图是做的DNA序列比对,有保守区和不保守区.我觉得,引物的3'端最好位于最保守的区域.

易虹苛3249什么是引物? -
全注柳15050953553 ______ [编辑本段]概念 引物,是一小段单链DNA或RNA,作为DNA复制的起始点,在核酸合成反应时,作为每个多核苷酸链进行延伸的出发点而起作用的多核苷酸链,在引物的3′-OH上,核苷酸以二酯链形式进行合成,因此引物的3′-OH,必须是游离...

易虹苛3249请问拿到测序的结果,怎么找不到引物序列? -
全注柳15050953553 ______ 你应该在DNAMan上进行比对,看引物能不能比对上(一个不变,一个反向互补),如果比不上,那可能就不是你要的序列,如果能比上,上游以引物第一个为分界线,去除前面的;下有一最后一个为分界线,去除后面的,剩下的就是目的序列.

易虹苛3249如何在NCBI中进行基因序列比对,比如小鼠p53基因与人类p53基因的比对 -
全注柳15050953553 ______ 首先找到小鼠和人类p53基因的序列,然后进ncbi首页,里面靠右的位置popular resources下第一个选项“blast”,打开以后,找“nucleotide blast”.进到那个页面有个框就是让你输序列的,如果要比对两个序列的话,要勾选下面的一个小的单选框“Align two or more sequences ”.就会出现两个框,分别输入人和小鼠的序列.点最下面大大的“blast”按钮,就可以了. 希望对你有帮助,欢迎追问~